针对您提出的“变造车牌没有证据怎么处理”这一问题，我会从法律程序和实际操作两个层面为您详细解答。
首先，从法律程序的角度来看，证据是处理任何违法行为的基础。在涉及变造车牌的案件中，如果没有确凿的证据，公安机关或交通管理部门确实难以直接对嫌疑人进行处罚。这是因为，根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，对违法行为的认定必须基于充分的证据，以确保处罚的公正性和合法性。
那么，在没有直接证据的情况下，应该如何处理呢？
收集间接证据：虽然直接证据（如监控录像、目击者证言等）可能缺失，但您可以尝试收集其他间接证据，如车辆行驶轨迹、车辆外观异常（如车牌区域有改动痕迹）、车辆信息与登记信息不符等。这些间接证据虽然不如直接证据有力，但在一定情况下，可以作为辅助证据，帮助公安机关或交通管理部门进行推断和认定。
向相关部门举报：如果您发现有人涉嫌变造车牌，即使没有直接证据，也可以向当地公安机关或交通管理部门进行举报。举报时，您可以提供您所掌握的所有相关信息，包括车辆信息、行驶时间、地点等。相关部门会根据您的举报进行调查，并尽可能收集证据以确认违法行为。
配合调查：在相关部门进行调查的过程中，您应积极配合，提供必要的协助和信息。这有助于加快调查进程，提高证据收集的效率。
了解法律后果：虽然您可能没有直接证据，但了解变造车牌的法律后果对于您来说也是重要的。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，使用伪造、变造的机动车号牌将面临行政拘留、罚款等严厉处罚。这有助于您认识到问题的严重性，并更加积极地配合相关部门的调查。
最后，我想强调的是，处理违法行为必须依法进行。在没有确凿证据的情况下，我们不能随意对他人进行指控或处罚。但同时，我们也应积极履行公民的责任，向相关部门举报违法行为，共同维护道路交通的安全和秩序。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。