针对套牌车被抓但无车主驾驶证据的情况，核心处理原则是：公安机关仍会依法对套牌车进行查处，并可能通过其他证据链追究相关责任人的法律责任，即使没有直接证据证明车主本人驾驶。以下从不同角度展开说明：

1. 套牌车本身的违法性及处理
   根据《道路交通安全法》第十六条，任何单位或个人不得伪造、变造或使用伪造、变造的机动车号牌。套牌车本身即构成违法，无论是否抓到实际驾驶人，公安机关均可对车辆进行扣留，并处以罚款（通常为2000-5000元）、记12分，甚至可能并处15日以下拘留。若车辆涉及其他违法行为（如盗抢、走私），还会移交相关部门进一步处理。

2. 无直接驾驶证据时的责任认定
   若无法证明车主本人驾驶，公安机关会通过其他证据链追究责任：

   • 车辆使用痕迹：如车内物品、行车记录仪、GPS轨迹等，可能指向实际使用人；
     
   • 证人证言：如目击者、同乘人员等指认驾驶人；
     
   • 车主的举证责任：车主需证明车辆被盗、被借或被他人擅自使用（如提供报警记录、借车协议等），否则可能因“未尽到管理义务”被追究连带责任。

3. 车主可能面临的法律后果

   • 行政责任：若车主无法证明车辆被他人使用，可能被认定为“放任套牌行为”，面临与驾驶人同等的行政处罚；
     
   • 民事责任：若套牌车造成交通事故，车主可能因“未尽到管理义务”被判承担部分或全部赔偿责任；
     
   • 刑事责任：若套牌行为涉及伪造国家机关证件、盗窃车辆等，可能触犯《刑法》，车主若知情或参与则需承担刑事责任。

4. 车主的应对建议

   • 配合调查：如实向公安机关说明车辆使用情况，提供相关证据（如借车记录、报警记录等）；
     
   • 主动举证：若车辆被盗或被他人擅自使用，尽快报警并保留证据，以证明自身无过错；
     
   • 法律维权：若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

总结：套牌车被抓后，即使无直接证据证明车主驾驶，公安机关仍会依法处理车辆，并通过其他证据追究责任。车主需积极配合调查，提供证据证明自身无过错，否则可能承担行政、民事甚至刑事责任。如有进一步疑问，可直接向我咨询。