长期病假是否扣工龄工资，需分情况讨论：

1. 若病假未超过6个月：

   • 根据相关规定，职工因患疾病或非因工负伤停止工作的医疗期间，在6个月内的，这段期间应计入本企业连续工龄。因此，病假未超过6个月时，工龄工资不受影响，企业应按照正常标准支付工龄工资。

2. 若病假超过6个月：

   • 超过6个月病愈后仍未回原企业工作的，除超过6个月的期间不计入工龄外，其前后本企业的工龄仍应合并计算。这意味着，长期病假超过6个月的部分，不计入工龄，因此这部分时间不会获得工龄工资。但病假前的工龄和病愈后回企业工作的工龄是合并计算的。

3. 特殊情形下的工龄计算：

   • 职工因工负伤停止工作的医疗期间，全部计入本企业工龄，不受6个月限制。
   • 企业转让、改组合并时，原有职工仍留企业工作的，其在转让、改组合并前的工龄计入本企业工龄。
   • 职工留职停薪期间、留用察看期间，也计入本企业工龄。

法律背景与建议：

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，在法定医疗期内，用人单位不得单方解除劳动合同。这意味着，病假期间职工的劳动关系是受保护的，企业不能因职工休病假而解除劳动合同或不计入工龄。
• 对于长期病假的职工，企业应按照相关规定支付病假工资和工龄工资。若企业违反规定，职工有权通过法律途径维护自己的合法权益。
• 建议职工在休长期病假时，务必保留好医院的诊断证明和相关医疗记录，以便在需要时证明自己的病假情况。同时，职工也应了解自己的工龄和工资待遇情况，确保企业按照规定支付工资。

可能的后遗症：

• 若企业未按照规定支付病假工资和工龄工资，职工可能面临经济损失。长期来看，这可能影响职工的退休待遇和社保权益。
• 若职工因病假问题与企业发生纠纷，可能需要通过劳动仲裁或诉讼等法律途径解决。这可能耗费职工的时间和精力，甚至影响其职业发展和心理健康。

总结与提醒：

• 长期病假是否扣工龄工资，需根据病假时长和具体情况来判断。
• 职工应了解自己的权益和法律规定，确保企业按照规定支付工资。
• 若遇到问题或纠纷，建议及时咨询专业律师（即我本人，池莹娟律师，专注于婚姻家庭、合同纠纷、经济纠纷、交通事故、刑事辩护、劳动纠纷领域），以便更好地维护自己的合法权益。