针对您提出的“住客因自身疾病身亡，酒店有保险，保险公司可以不赔付吗”这一问题，我将从保险理赔的基本原则、可能影响赔付的因素以及相关法律法规三个方面进行详细解答。

首先，从保险理赔的基本原则来看，保险公司是否赔付主要取决于保险合同中的条款约定。在一般情况下，如果住客在酒店内因自身疾病身亡，且该疾病属于保险合同中约定的保障范围，同时住客在投保时如实告知了健康状况，没有隐瞒既往病史，且持续支付了保险费用，那么保险公司应当按照合同约定进行赔付。

然而，也存在一些可能影响保险公司赔付的因素。其中最为关键的是保险合同中的免责条款。免责条款是保险合同中明确规定的，在某些特定情况下保险公司不承担赔付责任的条款。例如，如果住客的疾病属于保险合同中明确排除的保障范围，或者住客在投保时未如实告知健康状况，存在隐瞒既往病史的情况，那么保险公司有权根据免责条款拒绝赔付。

此外，还需要考虑的是相关法律法规的规定。根据《中华人民共和国社会保险法》第十七条，参加基本养老保险的个人，因病或者非因工死亡的，其遗属可以领取丧葬补助金和抚恤金。但这一条款主要针对的是基本养老保险，与酒店购买的商业保险可能不完全一致。不过，它体现了国家对于因病死亡人员遗属的关怀和保障，也提示我们在处理类似问题时需要关注相关法律法规的规定。

综上所述，保险公司是否赔付住客因自身疾病身亡的保险金，主要取决于保险合同中的条款约定以及住客在投保时的行为是否符合合同要求。如果合同中有明确的免责条款且住客的行为触发了这些条款，那么保险公司有权拒绝赔付。因此，在处理此类问题时，建议您首先仔细阅读保险合同中的条款约定，了解保险公司的赔付责任和免责范围；同时，也可以咨询专业的法律人士或保险顾问，以获取更为准确和全面的解答。