针对您提出的“鉴定费由原告承担，但被告预交如何执行”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在诉讼过程中，鉴定费的承担一般遵循“谁主张，谁负担”的原则。这意味着，如果原告主动提出鉴定申请以证明其主张的事实，那么通常原告需先行垫付鉴定费用。然而，这并不意味着鉴定费最终一定由原告承担。
鉴定费的最终承担方：
法院判决决定：鉴定费的最终承担方通常由法院根据审理结果来决定。如果原告的主张获得法院的支持，且被告存在过错或责任，那么法院可能会判决被告承担鉴定费。反之，如果原告的主张未被法院认可，那么鉴定费大概率仍由原告自行承担。
特殊情况：存在一些特殊情况，比如双方事先对鉴定事项有约定，那么鉴定费的承担就可能按照双方的约定来分担。此外，如果双方协商一致选定鉴定机构，且鉴定结果对双方责任划分有重要影响，法院也可能根据公平原则，综合案件具体情况决定双方分担鉴定费用的比例。
被告预交鉴定费的情况：
在您提到的情况中，如果鉴定费原本应由原告承担，但被告预交了，那么这通常意味着在诉讼过程中，可能由于某些原因（如原告经济困难、双方协商等），被告同意先行垫付鉴定费。然而，这并不改变鉴定费最终应由谁承担的原则。
执行方式：
法院判决执行：如果法院最终判决鉴定费应由原告承担，但被告已经预交，那么原告需要在判决生效后，按照法院指定的方式和期限，将鉴定费返还给被告。
双方协商执行：如果双方在诉讼过程中或判决后达成协议，约定鉴定费的分担方式，那么双方应按照协议执行。例如，双方可能约定鉴定费由双方平均分担，或者由某一方承担大部分费用等。
强制执行：如果原告未按照法院判决或双方协议履行返还鉴定费的义务，被告可以向法院申请强制执行。法院将依法采取强制措施，确保被告的合法权益得到保障。
总结与建议：
在诉讼过程中，鉴定费的承担是一个复杂且多变的问题。它可能受到多种因素的影响，包括原告的主张是否获得支持、被告是否存在过错或责任、双方事先是否有约定等。因此，在处理鉴定费问题时，建议您：
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。