在工伤期间，公司停发工资是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律法规的明确规定
根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，只要职工处于停工留薪期内，无论其是否能从事原工作或单位另行安排的工作，单位都应按时足额支付其原工资待遇，包括基本工资、绩效工资等各项收入。
二、停工留薪期的定义与期限
停工留薪期是指职工因工作遭受事故伤害或患职业病而需要暂停工作接受医疗救治的期间。这一期限一般不超过12个月，若伤情严重或情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认后，可适当延长，但延长期限同样不得超过12个月。在停工留薪期内，职工享受的是原工资福利待遇不变的政策。
三、单位停发工资的违法性分析
单位在停工留薪期内停发工伤职工的工资，显然违反了《工伤保险条例》的相关规定。这种行为不仅损害了工伤职工的合法权益，也违反了国家对工伤职工的保护政策。工伤职工有权要求单位补发工资，并可以通过法律途径维护自己的权益。
四、工伤职工的权益保障措施
协商解决：工伤职工应首先尝试与单位进行协商，要求其补发工资。在协商过程中，可以引用《工伤保险条例》的相关规定，说明单位停发工资的违法性。
投诉举报：若协商无果，工伤职工可以向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并督促单位支付工资。劳动监察部门有权对单位的违法行为进行查处，并要求单位限期改正。
法律途径：在必要情况下，工伤职工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律手段解决争议。若劳动仲裁裁决生效后单位仍不履行，可向人民法院申请强制执行。
五、特殊情况下的工资发放问题
虽然一般情况下单位在停工留薪期内应全额支付工伤职工的工资，但也存在一些特殊情况。例如，如果绩效工资严格与员工的工作成果、业绩完成情况挂钩，且在工伤期间员工确实无法完成相应的工作任务，没有实际的业绩产出，单位可以根据经过公示或告知员工的绩效工资考核制度，合理停发绩效工资。但这种情况需要单位确保考核制度明确、合理，并能够证明员工在工伤期间客观上无法履行工作职责从而没有产生相应业绩。不过，这种特殊情况并不改变单位在停工留薪期内应支付基本工资等固定福利待遇的义务。
总结与建议：
在工伤期间，公司停发工资是不合法的。工伤职工应了解自己的合法权益，并在必要时采取协商、投诉举报或法律途径等措施维护自身利益。同时，单位也应严格遵守相关法律法规，确保工伤职工的合法权益得到保障。如果您在工伤期间遇到工资停发等问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。