关于您提出的“指定居住期间工资怎么发”的问题，这确实是一个涉及劳动权益的重要议题。以下是我为您详细梳理的解答：

首先，我们需要明确的是，指定居住（这里假设您指的是类似监视居住等法律强制措施下的居住状态）期间工资的发放，主要依据的是单位内部的规章制度以及您与单位签订的劳动合同。

1. 劳动合同的约定：

   • 如果您的劳动合同中明确规定了在特殊情形下（如被采取法律强制措施期间）工资的发放标准与方式，那么单位应当严格按照合同来执行。这是最直接也最明确的依据。

2. 合同未明确时的处理：

   • 如果劳动合同中没有对这种情况作出明确规定，那么单位就需要依据相关的法律法规以及公平合理的原则来处理。
   • 通常情况下，单位不会直接停发您的全部工资。而是会根据您实际的工作情况，如是否能够通过远程方式完成部分工作、是否因被指定居住而无法正常到岗的天数等，来适当调整工资的发放。
   • 例如，单位可能会扣除您因被指定居住而无法正常工作天数对应的工资部分，但不会完全停发。

3. 法律原则与单位运营：

   • 在处理这类问题时，单位需要全面考虑多种因素，既要保障劳动者的合法权益，又要维护单位的正常运营秩序。
   • 如果单位随意停发工资，可能会引发劳动纠纷，对单位的声誉和运营造成不利影响。

4. 实际案例参考：

   • 以小朱的案例为例，他在公司工作期间因涉嫌案件被采取监视居住措施。公司停发了他的全部工资，但小朱认为劳动合同中并未明确这种情况下的工资发放方式，因此公司不应直接停发。
   • 最终，经过协商或法律途径，公司可能会根据小朱的实际工作情况适当调整工资，而不是完全停发。

综上所述，指定居住期间工资的发放并不是一个简单的问题，它涉及到劳动合同的约定、法律法规的遵循以及公平合理原则的应用。如果您遇到了类似的问题，建议您首先查看劳动合同中的相关条款，然后与单位进行沟通协商。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。