针对同一违法建筑，规划部门罚款后，住建部门一般不能再就同一违法行为进行罚款，这违反了“一事不二罚”的原则。以下从不同角度为您详细分析：
一、“一事不二罚”原则的法律基础
根据《中华人民共和国行政处罚法》第二十四条的规定：“对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。”这一原则，即“一事不二罚”原则，是行政处罚的基本原则之一，旨在防止行政机关对同一违法行为进行重复处罚，保护当事人的合法权益。
二、同一违法行为的认定
在认定是否为同一违法行为时，关键在于判断两次处罚是否针对同一事实和同一法律关系。例如，若规划部门已就违法建筑擅自改变结构的行为进行了罚款，而住建部门又以同一违法建筑未按照规划许可证规定建设为由进行罚款，且两次处罚针对的是同一违法事实（即将两层商业改建为三层），则住建部门的处罚可能违反“一事不二罚”原则。
三、不同角度的分析
从处罚对象的角度：
- 若两次处罚均针对同一违法建筑和同一违法行为，则住建部门的再次罚款可能构成重复处罚。
- 若住建部门的处罚是针对违法建筑的其他方面（如消防安全、环保等），且这些方面与规划部门的处罚不重叠，则可能不构成重复处罚。但这种情况较为少见，且需要具体分析。
从处罚依据的角度：
- 无论规划部门还是住建部门，其处罚依据均应基于违法建筑的具体违法行为。若两次处罚均基于同一违法行为，则违反“一事不二罚”原则。
- 即使两次处罚依据的法律法规不同（如一次依据《城乡规划法》，一次依据《建筑法》），但若针对的是同一违法行为，仍可能构成重复处罚。
从实际案例的角度：
- 已有实际案例表明，针对同一违法建设行为，不同行政机关分别作出罚款的处罚决定，可能违反“一事不二罚”原则。例如，河南省高级人民法院的再审裁定中，就明确指出了这一点。
四、法律建议
- 对于违法建筑的所有者或建设者：若已就违法建筑行为接受了某一行政机关的罚款处罚，且认为其他行政机关的再次罚款可能违反“一事不二罚”原则，可以依法提出行政复议或行政诉讼，维护自己的合法权益。
- 对于行政机关：在行使处罚权时，应严格遵守“一事不二罚”原则，避免对同一违法行为进行重复处罚。同时，应加强部门间的沟通与协调，确保处罚的合法性和合理性。
总结来看，针对同一违法建筑，规划部门罚款后，住建部门一般不能再就同一违法行为进行罚款。若您遇到类似情况，或有其他关于房屋产权的法律问题，欢迎直接向我咨询。