结论：公司法人用有土地使用证但没有房产证的房屋出资，在符合一定条件下是合法的，但存在一定风险和不确定性。

合法性分析

1. 土地使用权出资的合法性：

   • 根据《公司法》第二十七条，股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。因此，土地使用权作为出资方式是合法的。
   • 在本案例中，公司法人拥有土地使用证，这表明其对该土地享有合法的使用权，有权将其作为出资。

2. 房产证缺失的影响：

   • 房产证是房屋所有权的法律凭证，没有房产证可能意味着房屋的所有权存在争议或未得到法律确认。
   • 然而，出资的合法性并不完全取决于房产证的存在。如果土地使用权清晰，且房屋的建设、使用等符合相关法律法规，即使没有房产证，也不一定影响土地使用权作为出资的合法性。但需要注意的是，房产证缺失可能增加出资的不确定性，如在未来办理房产过户、抵押等手续时可能遇到障碍。

风险与不确定性

1. 产权纠纷风险：

   • 没有房产证，房屋的所有权可能存在争议。如果未来出现其他权利人主张房屋所有权，可能导致出资的合法性受到质疑。

2. 办理房产证的风险：

   • 如果房屋长期未办理房产证，可能存在规划、建设等方面的违规问题。这些问题可能导致未来无法办理房产证，进而影响房屋的价值和出资的效力。

3. 公司运营风险：

   • 如果出资的房屋存在产权问题，可能影响公司的正常运营。例如，在需要抵押房屋融资时，可能因房产证缺失而无法办理抵押手续。

建议与措施

1. 核实土地使用权和房屋建设情况：

   • 在出资前，应核实土地使用权的合法性和房屋的建设情况，确保符合相关法律法规。

2. 尽快办理房产证：

   • 如果可能，应尽快办理房产证，以明确房屋的所有权，减少未来可能出现的产权纠纷。

3. 签订详细的出资协议：

   • 在出资时，应签订详细的出资协议，明确出资方式、出资额、产权归属等关键条款，以保障各方权益。

4. 咨询专业律师：

   • 由于房产和土地问题涉及复杂的法律法规，建议在出资前咨询专业律师，以获取更全面的法律意见和风险评估。当然，如果你有相关法律问题，也可以直接向我咨询，我专注于婚姻家庭、合同纠纷、房产纠纷领域，能够为你提供专业的法律服务。

总结：公司法人用有土地使用证但没有房产证的房屋出资，在符合一定条件下是合法的，但存在一定风险和不确定性。为了降低风险，建议在出资前核实相关情况、尽快办理房产证、签订详细的出资协议，并咨询专业律师。