关于耕地上堆放石子超过多少平米算违法的问题，实际上并没有一个固定的平米数标准来直接判定违法。这是因为违法性的判定主要取决于堆放行为是否违反了土地管理法规，以及是否对耕地造成了破坏或改变了其用途，而非单纯依据堆放的面积大小。
一、法律背景与规定
根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，耕地是受到严格保护的，任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地，也不得擅自改变土地用途。对于耕地上堆放石子等行为，如果未经批准且对耕地造成了破坏或改变了其农业用途，那么这种行为就是违法的。
二、违法性的判定因素
是否经过批准：如果堆放石子等行为经过了相关部门的批准，并且符合土地利用规划和农业用途的要求，那么这种行为就是合法的。反之，如果未经批准，则可能构成违法。
是否对耕地造成破坏：堆放石子等行为如果对耕地造成了破坏，如导致土壤结构改变、肥力下降等，那么这种行为就是违法的。即使堆放面积不大，但如果对耕地造成了实质性损害，也可能被认定为违法。
是否改变土地用途：耕地的主要用途是农业生产。如果堆放石子等行为导致耕地无法再进行农业生产，或者改变了其原有的农业用途，那么这种行为就是违法的。
三、法律建议与后果
遵守土地管理法规：在进行任何与耕地相关的活动时，都应严格遵守土地管理法规，确保活动的合法性和合规性。
及时申请批准：如果需要在耕地上堆放石子等物品，应提前向相关部门申请批准，并按照批准的要求进行堆放。
承担法律责任：如果未经批准在耕地上堆放石子等物品，且对耕地造成了破坏或改变了其用途，那么将可能面临行政处罚，甚至刑事责任。
举例说明：假设某农户未经批准，在自家耕地上堆放了大量石子，导致耕地无法再进行农业生产。这种行为就违反了土地管理法规，因为农户未经批准改变了耕地的用途，并对耕地造成了破坏。在这种情况下，无论堆放的石子面积多大，该农户都可能面临法律责任。
因此，判断耕地上堆放石子是否违法，不能单纯依据堆放的面积大小，而应综合考虑是否经过批准、是否对耕地造成破坏以及是否改变土地用途等因素。如果您在耕地上堆放石子等物品时存在疑问或担忧，建议直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。