确认劳动关系和双倍工资不属于两个完全独立的仲裁事项，它们可以同时申请仲裁。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律依据及合理性
确认劳动关系的法律依据：
- 确认劳动关系是劳动者主张其他权益（如经济补偿、社保补缴、双倍工资等）的基础。根据相关法律法规，劳动者在申请工伤赔偿、主张未签劳动合同的双倍工资等权益时，均需先确认与用人单位存在劳动关系。
主张双倍工资的法律依据：
- 依据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应向劳动者每月支付二倍的工资。这是对用人单位未依法签订书面劳动合同的一种惩罚性赔偿，旨在保护劳动者的合法权益。
同时申请的合理性：
- 确认劳动关系与主张双倍工资虽为独立请求，但紧密相关。确认劳动关系是主张双倍工资的前提，两者合并申请可节约司法资源，减少维权成本，提高纠纷解决效率。同时，这也符合劳动争议仲裁的受理范围，即包括因确认劳动关系发生的争议以及因劳动报酬等发生的争议。
二、申请仲裁时的注意事项
准备仲裁申请书：
- 在仲裁申请书中，应清晰、准确地阐述确认劳动关系和主张双倍工资的事实和理由。包括入职时间、工作内容、工资支付情况，特别是用人单位未依法签订书面劳动合同的情况。
充分收集证据：
- 证明劳动关系的证据：如工作证、考勤记录、工资发放记录、同事证言、社保缴纳记录等。
- 证明未签订书面劳动合同的证据：如入职沟通记录、邮件往来、证人证言等能体现双方未签订合同事实的材料。
注意仲裁时效：
- 双倍工资的仲裁时效为一年，从用人单位应当支付双倍工资的最后一个月届满之日起计算。劳动者应确保在时效内提出申请，否则可能面临双倍工资请求得不到支持的风险。一般而言，劳动仲裁时效从离职之日起计算也为一年。
提交至有管辖权的劳动仲裁委员会：
- 劳动者应向用人单位所在地或劳动合同履行地的劳动仲裁委员会提交仲裁申请书。申请书应写明诉求、事实与理由，并附上相关证据材料清单。
三、实际操作中的建议
- 合并申请：为了高效解决纠纷，建议劳动者在申请仲裁时，将确认劳动关系和主张双倍工资的请求合并提出。这样不仅可以减少维权成本，还可以避免因分别申请而可能导致的程序繁琐和时效问题。
- 咨询专业律师：虽然我在此为您提供了详细的解答，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，建议您在申请仲裁前咨询专业律师，以确保您的权益得到充分保障。
综上所述，确认劳动关系和双倍工资可以同时申请仲裁。劳动者在申请时需确保提供充分的证据材料，并在仲裁时效内提出申请。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。