针对您提出的问题，即“有公司印章的借条款，通过银行转账到公司账户，但经办人不是公司职员，法院会支持借款吗？”以下是我的详细分析：
借款合同的有效性：
- 首先，我们需要关注的是借款合同本身的有效性。根据《民法典》的相关规定，一个有效的合同需要满足行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定，以及不违背公序良俗等条件。
- 在您描述的情况下，借款合同上盖有公司的印章，这通常意味着公司作为合同的一方，对合同内容表示了认可。只要印章真实且公司确实有借款的意图，合同在形式上就是有效的。
经办人身份的影响：
- 经办人不是公司职员这一事实，并不直接导致借款合同无效。关键在于经办人是否有公司的授权来代表公司进行借款行为。
- 如果经办人持有公司的有效授权文件（如授权委托书），并且该授权明确包括了借款事项，那么经办人的身份就不会影响借款合同的效力。
- 如果经办人没有公司的授权，或者授权不明确，那么这可能会引发关于合同效力的争议。但即便如此，也不能直接断定合同无效，而是需要进一步审查合同签订过程中的具体情况，以及公司是否实际接受了借款等事实。
银行转账的证据作用：
- 银行转账记录是证明借款实际发生的重要证据。如果借款已经通过银行转账的方式支付到了公司账户，那么这在一定程度上证明了借款合同的实际履行。
- 法院在审理此类案件时，会综合考虑合同的有效性、实际履行情况以及双方当事人的陈述和证据等因素来作出判决。
法院的可能判决：
- 如果合同有效且实际履行：法院很可能会支持借款的存在，并判决公司承担还款责任。
- 如果合同存在瑕疵但实际履行：法院可能会根据实际情况，如公司是否实际使用了借款、是否从中获得了利益等，来酌情判断公司的还款责任。
- 如果合同无效且未实际履行：或者虽然合同形式上存在但公司并未实际收到借款，那么法院可能会驳回借款方的诉讼请求。
法律建议：
- 如果您是借款方，建议您保留好所有与借款相关的证据，包括借款合同、银行转账记录、授权委托书（如果有）等，以便在发生争议时能够充分证明自己的主张。
- 如果您是公司方，并且对借款事项存在异议，建议您及时审查借款合同的签订过程、授权情况以及借款的实际使用情况，以便在必要时采取法律措施维护自己的权益。
可能面临的法律后果：
- 如果法院最终判决公司承担还款责任，而公司未能按时履行还款义务，那么公司可能会面临被强制执行、列入失信被执行人名单等法律后果。
- 如果借款合同存在欺诈、胁迫等情形，导致合同无效或被撤销，那么相关责任方可能会面临民事赔偿甚至刑事责任等法律后果。
总结与引导：
每个案件的具体情况都有所不同，法院在审理时会综合考虑各种因素来作出判决。如果您对此类问题还有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。