结论：针对您描述的情况，您可以通过以下步骤来起诉相关责任方以追回借款。
一、明确被告主体
工厂（普通合伙）作为被告：
- 如果借条上有工厂的公章，且借款行为被认定为工厂的行为（例如，借款用于工厂经营），那么工厂作为普通合伙企业，应当作为被告。
- 根据《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定，普通合伙企业的债务，由全体合伙人承担无限连带责任。因此，在起诉时，您可以将工厂及其全体合伙人列为共同被告。
法人代表作为被告：
- 法人代表在借条上签字，如果其签字行为是代表工厂进行的，且款项也转账给了法人代表（但用于工厂经营），则法人代表个人可能不直接承担还款责任，除非存在滥用职权或个人财产与工厂财产混同的情况。
- 如果法人代表以个人名义借款，但款项实际用于工厂经营，且您能证明这一点，那么您可以选择同时起诉法人代表和工厂，要求他们共同承担还款责任。不过，在大多数情况下，如果借款行为被认定为工厂行为，法人代表个人可能不作为主要被告。
二、准备起诉材料
- 借条：作为借款关系的直接证据，借条上应明确借款金额、借款期限、利息（如有）以及借款人和出借人的信息。
- 转账记录：证明款项已经实际支付给法人代表（或工厂指定的账户），这是确认借款事实的重要证据。
- 工厂信息：包括工厂的名称、地址、法定代表人信息以及全体合伙人的信息（如果起诉工厂及其合伙人）。
- 其他证据：如聊天记录、邮件往来等，证明借款的用途、借款时的协商过程等，有助于增强您的诉讼主张。
三、起诉流程
- 撰写起诉状：明确诉讼请求（如要求被告偿还借款本金及利息）、事实与理由（详细阐述借款经过、证据情况等）以及法律依据。
- 提交法院：将起诉状及相关证据材料提交至有管辖权的人民法院（通常是被告住所地或合同履行地法院）。
- 等待法院受理：法院在收到起诉材料后，会进行审查，符合受理条件的，会予以受理并通知您缴纳诉讼费。
- 参与诉讼：在法院受理案件后，您需要按照法院的通知参与诉讼活动，包括开庭审理、举证质证等。
四、注意事项
- 诉讼时效：注意借款的诉讼时效问题，一般自借款到期之日起三年内提起诉讼。如果超过诉讼时效，您可能会丧失胜诉权。
- 证据保全：在起诉前或诉讼过程中，如果担心证据可能灭失或难以取得，可以向法院申请证据保全。
- 律师协助：虽然您可以自行起诉，但考虑到法律程序的复杂性和专业性，建议您在必要时寻求专业律师的协助，以提高诉讼效率和胜诉率。
最后，如果您在起诉过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。