若法院已判决要求归还拖欠工资，但涉及纳税问题，您应首先明确纳税义务，并依法履行纳税及工资归还责任。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、纳税义务与工资归还的关系
纳税义务：根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关税法规定，个人取得工资、薪金等所得，应当依法缴纳个人所得税。这意味着，无论工资是否被拖欠，一旦工资实际发放或应发放，您都有义务按照税法规定缴纳相应的税款。
工资归还：若法院判决要求您归还拖欠的工资，这通常意味着您之前未按时支付员工工资，现在需要补发。在补发工资时，您仍需按照税法规定，为员工代扣代缴个人所得税（如果工资达到纳税标准）。
二、具体操作建议
计算应纳税额：
- 在归还拖欠工资前，首先计算应补发的工资总额。
- 根据税法规定，计算应缴纳的个人所得税额。这通常涉及确定应纳税所得额、适用税率和速算扣除数等步骤。
- 计算公式：应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。其中，应纳税所得额 = 工资总额 - 免征额 - 专项扣除（如社保、公积金等）- 专项附加扣除（如子女教育、继续教育等）。
履行纳税义务：
- 在补发工资时，从工资中代扣代缴个人所得税。
- 如果之前未代扣代缴，现在需要补缴税款及可能的滞纳金（如果存在逾期缴纳的情况）。
归还工资与税款：
- 将补发的工资（扣除应纳税额后）支付给员工。
- 同时，确保将代扣代缴的个人所得税及时上缴至税务机关。
三、法律后果与风险提示
未履行纳税义务的法律后果：
- 如果未按照税法规定缴纳个人所得税，可能面临税务机关的处罚，包括罚款、加收滞纳金等。
- 在严重情况下，还可能涉及刑事责任。
未归还拖欠工资的法律后果：
- 如果未按照法院判决归还拖欠工资，员工可以申请强制执行，法院可能采取查封、扣押、拍卖等措施来强制执行判决。
- 这将对您的信用记录和商业声誉造成负面影响。
四、特殊情况处理
- 如果工资未达到纳税标准：则无需缴纳个人所得税，但仍需按照法院判决归还拖欠的工资。
- 如果存在税收优惠政策：如某些地区或行业对特定人群有税收减免政策，您可以咨询当地税务机关了解具体政策并申请享受。
建议您在处理此类问题时，务必咨询专业税务人员或律师，以确保您的操作符合税法规定和法院判决要求。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。