面对公司拖欠工资但已申报个税的情况，你可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

1. 与公司协商沟通

   • 主动沟通：首先，尝试与公司的财务部门或人力资源部门进行友好沟通，了解拖欠工资的具体原因及个税申报情况。在沟通过程中，保持冷静和理性，明确表达你的诉求，即要求公司尽快补发工资并更正个税申报（如果存在错误）。
   • 收集证据：在沟通过程中，务必保留好电子邮件、短信、微信聊天记录等沟通记录。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。

2. 向劳动行政部门举报

   • 举报方式：如果与公司沟通无果，你可以携带劳动合同、工资条、考勤记录等证据，前往公司所在地的劳动监察大队进行线下投诉；或者通过当地劳动监察部门的官方网站、手机APP进行线上投诉。
   • 处理流程：劳动监察部门在接到投诉后，会对公司进行调查核实。若情况属实，将责令公司限期支付拖欠的工资，并可能对公司进行处罚，如罚款、列入失信名单等。

3. 申请劳动仲裁

   • 准备材料：包括仲裁申请书（明确写明基本信息、仲裁请求及事实和理由）、劳动合同、工资条、考勤记录、银行工资流水明细、个税申报记录等证据。
   • 仲裁流程：向劳动争议仲裁委员会提交申请材料，经审查符合受理条件的，予以立案。之后，仲裁庭会安排开庭审理，双方需出庭陈述观点和证据。最终，仲裁庭将根据双方陈述和证据进行裁决，裁决结果具有强制执行力。

4. 解除劳动合同并要求经济补偿

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条和第四十六条，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以单方解除劳动合同，并要求支付经济补偿金。
   • 补偿标准：经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

5. 向人民法院提起诉讼

   • 诉讼依据：若对劳动仲裁结果不满意，或者公司未执行仲裁裁决，你可以根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，向人民法院提起诉讼，要求用人单位承担法律责任，包括支付拖欠的工资、经济补偿金以及可能的赔偿金等。

6. 向税务部门反映情况

   • 反映问题：如果公司拒绝更正个税申报，或者你发现个税申报存在错误（如因拖欠工资导致多扣或少扣），你可以向当地税务部门反映情况，并提供相关证据。
   • 税务处理：税务部门将对公司的个税申报进行调查，并根据实际情况进行更正。同时，你也可以申请更正个人所得税申报，提供工资未发放的证明等证据，以确保个税申报的准确性。

7. 个税申报处理建议

   • 实际申报：个人所得税应按照实际发放的工资进行申报。对于拖欠但已申报个税的工资部分，你在申报个税时只能申报已实际收到的工资。
   • 补发工资处理：对于补发的工资，你应向主管税务机关提供书面说明，情况属实的，可将补发工资分摊到所属月份工资薪金所得中合并计算缴纳个人所得税。

在处理此类问题时，你还需要注意以下几点：

• 保存好所有相关证据：包括劳动合同、工资条、考勤记录、银行工资流水明细、个税申报记录、沟通记录等。这些证据在后续维权过程中将起到至关重要的作用。
• 了解自己的合法权益和维权途径：在采取行动之前，务必了解自己的合法权益和可能的维权途径。这样可以帮助你更有效地维护自己的权益，避免走弯路。
• 积极采取措施维护自己的权益：面对公司拖欠工资的情况，不要忍气吞声或者拖延时间。积极采取措施维护自己的权益是至关重要的。

如果你在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。