核心前提：用户咨询的是“内部承包过了三年”的处理方式，这里的“内部承包”可能涉及企业内部承包经营合同，且合同期限已满三年后的处理问题。
结论前置：
- 若合同有明确约定：首先应查看内部承包经营合同中关于期限届满后的具体约定，如续签、终止、资产处置等条款，并按照合同约定执行。
- 若合同无明确约定或约定不明：则需根据《民法典》及相关法律法规，结合双方实际履行情况、公平原则等，协商确定后续处理方式。
详细分析：
合同有明确约定的情况：
- 内部承包经营合同通常会明确约定承包期限、期限届满后的处理方式（如是否自动续签、需否重新签订合同、资产如何处置等）。
- 若合同中有明确约定，双方应严格按照合同约定执行，避免产生纠纷。例如，若合同约定期限届满后自动续签一年，则无需另行签订合同，承包关系继续有效。
合同无明确约定或约定不明的情况：
- 若合同未对期限届满后的处理方式作出明确约定，或约定存在歧义、不明确，则双方需根据《民法典》及相关法律法规，结合实际履行情况、公平原则等，进行协商。
- 协商过程中，可考虑以下因素：承包期间的经营状况、资产增值情况、双方对继续承包的意愿、市场行情等。
- 若协商不成，任何一方均可向人民法院提起诉讼，请求法院根据实际情况判决后续处理方式。在此过程中，建议双方保留好相关证据，如承包合同、经营记录、资产清单等，以备诉讼之需。
特别提示：
- 内部承包经营合同涉及企业内部的经营管理，建议双方在签订合同时，就期限届满后的处理方式作出明确、具体的约定，以避免后续纠纷。
- 若在处理过程中遇到法律难题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况，提供专业、详细的法律建议。