培训机构收取50元违约金是否合法，需结合具体情况判断，核心在于合同条款的约定以及违约金的性质、数额与适用条件是否符合法律法规。以下是对此问题的详细分析：

一、违约金的合法性基础

根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这表明，在法律上，培训机构与学员之间约定违约金是被允许的，但需满足以下条件：

1. 双方自愿原则：合同中的违约金条款应是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情况。
2. 不违反法律法规：违约金条款不得违反法律、行政法规的强制性规定，否则该条款无效。

二、违约金的合理性要求

1. 数额合理：违约金的数额应当与实际损失相当，不应过高或过低。对于50元的违约金，如果这一数额与培训机构因学员违约所遭受的实际损失相当，或者是在合同中双方自愿约定的一个合理数额，那么这一违约金数额就是合法的。反之，如果50元违约金过高或过低，与实际损失不符，则可能因显失公平而被法院或仲裁机构调整。
2. 调整机制：法律允许在违约金数额不合理时，通过诉讼或仲裁途径进行调整。如果学员认为50元违约金过高或过低，可以请求法院或仲裁机构根据实际损失情况进行适当调整。

三、违约金的适用条件

1. 存在违约行为：违约金的支付以一方违约为前提。若学员未出现违约行为，则无需支付违约金。
2. 合同约定明确：合同中必须明确约定违约金条款，包括违约金的数额、支付方式及适用情形等。若合同未约定或约定不明确，则不能要求学员支付违约金。对于50元违约金而言，如果合同中有明确约定，且学员确实存在违约行为，那么学员就需要按照合同约定支付这一违约金。

四、特殊情形下的违约金处理

1. 格式条款问题：如果培训机构提供的是格式合同，且其中的违约金条款存在不合理地免除其责任、加重学员责任或限制学员主要权利等情形，该条款可能因显失公平而无效。在这种情况下，即使合同中约定了50元违约金，学员也有权拒绝支付。
2. 退费扣违约金：在培训机构退费过程中扣除违约金是否合理，同样取决于合同条款的约定。若合同中明确规定了退费需扣除违约金的条款，且该条款合法有效，则培训机构在退费时扣除违约金（包括50元）是合理的。否则，单方面扣除违约金可能构成违约行为。

五、建议与风险提示

• 审查合同条款：在签订培训合同时，学员应仔细审查合同中的违约金条款，确保其合理、合法，并明确自己的权利和义务。
• 协商与沟通：如果学员对违约金存在疑问或认为不合理，首先应与培训机构进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
• 法律途径解决：协商不成的，学员可以通过诉讼或仲裁等法律途径解决争议。在这些程序中，法院或仲裁机构将根据法律法规和合同条款的具体内容来判断违约金的合法性和合理性。

综上所述，培训机构收取50元违约金是否合法，需结合合同条款的约定、违约金的性质与数额以及适用条件等多方面因素进行综合判断。如果您对此问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。