扣留公款是否合法，这个问题涉及到对公款的处理和使用权限，以及可能涉及的法律后果。首先，我们要明确的是，公款是属于国家或集体的财产，其使用和管理必须严格遵守相关的法律法规和财务规定。

从一般意义上来说，扣留公款是不合法的。因为公款的使用和管理有明确的制度和流程，任何未经授权或违反规定的行为都可能构成对公款的不当使用或挪用。具体来说，如果某人或某机构擅自扣留公款，不按照规定的用途、程序或时间进行使用或上缴，就可能构成挪用公款的行为。

挪用公款是一种严重的违法行为，其法律后果可能包括刑事责任和行政责任。根据相关法律和司法解释，挪用公款罪有三种不同的情况：一是挪用公款归个人使用，数额较大、超过三个月未还的；二是挪用公款数额较大，归个人进行营利活动的；三是挪用公款归个人使用，进行赌博、走私等非法活动的。这三种情况都构成了挪用公款罪，并会受到相应的法律制裁。

因此，扣留公款是不合法的，任何机构或个人都不应该擅自扣留或使用公款。如果发现有公款被不当使用或挪用的情况，应该立即向相关部门报告，并配合调查处理。同时，我们也应该加强公款的管理和监督，确保公款的安全和合规使用。