协议没有一式两份并不影响其法律效力。

在探讨此问题时，我们首先要明确合同或协议生效的基本条件。依法成立的合同，自成立时起即具备法律效力，但需注意法律另有规定或当事人另有约定的情况。具体来说，合同的生效需满足主体适格、意思表示真实、内容合法以及形式合法等核心要件。

关于协议份数的问题，并非合同生效的必备要件。只要协议满足了上述的生效条件，无论是一份还是多份，都不影响其法律效力。一式两份的协议主要是为了方便双方当事人各自持有一份，以便在履行协议、主张权利或解决纠纷时作为依据。然而，这并不意味着缺少一式两份的形式就会否定协议的效力。

实际上，协议的效力主要取决于其内容是否符合法律规定，双方是否具备相应的民事行为能力，以及双方的意思表示是否真实等因素，而与协议的份数无直接关联。

建议：

尽管协议份数不是生效的必要条件，但为了避免后续可能出现的纠纷和不必要的麻烦，建议双方在签订协议时尽量签订一式两份或多份，并妥善保存各自的协议文本。这样，在需要时可以迅速提供证据，维护自己的合法权益。

法律依据：

根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条的规定，一个有效的民事法律行为（包括协议签订）需满足以下条件：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。这一规定进一步确认了协议效力与份数无直接关联的事实。