合同甲方单位只盖章，其有效性并不绝对，而是取决于多个因素。以下是对此问题的详细分析：
一、盖章的法律效力
一般情况：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在合同上加盖公章是表明合同内容为签订方真实意思表示的一种方式，通常具有法律效力。这意味着，在没有特殊约定或法定要求的情况下，甲方在合同上只盖章不签字，合同通常是有效的。
特殊情况：
- 如果合同明确约定了“本合同自双方签字并盖章之日起生效”，那么仅有盖章而未签字的，合同可能尚未生效。这是因为当事人已通过合同条款对合同生效条件作出了特别约定，应严格遵循该约定。
- 如果盖章的是假章或未经授权的章，也可能导致合同无效。因为这种情况下，盖章行为并不能真实反映公司的意思表示。
二、影响合同效力的其他因素
合同内容：
- 合同内容是否合法、是否违反公序良俗等，也会影响合同的效力。即使合同上有甲方的盖章，但如果合同内容违法或违反公序良俗，该合同也可能被认定为无效。
实际履行情况：
- 即使合同上没有盖章也没有签字，但如果双方都已经开始履行合同约定的义务，且对方接受，那么根据《民法典》的相关规定，该合同仍然可以视为有效。这体现了法律对实际履行行为的认可和保护。不过，这种情况并不改变盖章在合同成立和效力上的通常作用。
三、建议与风险提示
审查合同条款：
- 在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于合同生效条件的约定。如果合同中明确要求了签字并盖章，那么应确保同时满足这两个条件。
确保盖章的真实性和合法性：
- 在使用公章时，应确保公章的真实性和合法性。避免使用假章或未经授权的章，以免导致合同无效或引发其他法律纠纷。
保留相关证据：
- 在合同履行过程中，应保留好与合同相关的证据，如履行义务的证明、对方接受的证明等。这些证据在发生纠纷时可能起到关键作用。
如果有任何关于合同纠纷或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。