立案后撤销案件，通常不会留下案底。以下是对此问题的详细分析：

一、案底的定义与形成条件

案底，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录。它通常是在刑事诉讼过程中，被法院认定为有罪的被告人所留下的犯罪记录。这意味着，只有经过法院的刑事审判，并作出有罪判决，才会形成案底。

二、撤案的法律意义

撤案，即撤销案件，意味着在刑事诉讼过程中，由于各种原因（如证据不足、犯罪嫌疑人死亡、情节显著轻微等），导致案件被取消或终止，从而没有进入审判阶段。撤案本身就表明法院并未对行为人进行刑事审判，也未作出有罪判决。

三、撤案后不会留下案底的原因

1. 未经过审判和定罪：撤案意味着案件未经过法庭的审理和裁决，因此不会形成案底。这是撤案后不会留下案底的最直接原因。
2. 法律规定的保障：根据《刑事诉讼法》的相关规定，任何单位和个人发现有犯罪事实或者犯罪嫌疑人，都有权利和义务向公安机关、人民检察院或者人民法院报案或者举报。但同时，法律也规定了对于不属于自己管辖的案件应当移送主管机关处理，并且对于不符合起诉条件的案件，人民检察院可以作出不起诉决定，从而导致案件被撤销。这些规定为撤案提供了明确的法律依据和程序要求，也保障了撤案后不会留下案底。

四、特殊情况下的考虑

虽然撤案后通常不会留下案底，但在某些特殊情况下，如案件涉及国家安全、社会稳定等重大利益时，相关部门可能会对案件进行特殊处理，并保留相关记录。然而，这种情况并不常见，且通常不会对个人产生长期的负面影响。

五、法律建议

1. 了解撤案程序：如果您或您的亲友面临撤案的情况，建议了解相关的撤案程序和法律规定，以确保自己的权益得到保障。
2. 咨询专业律师：虽然撤案后通常不会留下案底，但在某些复杂或特殊的情况下，咨询专业律师可以提供更具体和个性化的法律建议。如果您有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。

总结：立案后撤销案件，通常不会留下案底。这是因为撤案意味着法院并未对行为人进行刑事审判，也未作出有罪判决。然而，在特殊情况下，相关部门可能会对案件进行特殊处理。因此，了解相关的法律规定和程序对于保障个人权益至关重要。如果您有任何法律问题或疑虑，请随时向我咨询。