结论前置：刑事案件立案以后撤销，在一般情况下是不会留下案底的。但如果在案件调查过程中当事人受到行政处罚，或案件已进入法院审判程序并有罪判决，则可能留下相关记录。以下是对这一问题的详细分析：
一、不会留下案底的情况
没有犯罪事实：若经侦查发现并无实际犯罪行为，如误报、错报事件，案件撤销后，当事人不会有案底。这是因为案底的形成需要以犯罪事实的存在和法院的有罪判决为前提。
情节显著轻微、危害不大：对于某些行为虽看似犯罪，但实际情节特别轻微，对社会危害极小，法律不认定为犯罪的情况，案件撤销后，同样不会留下案底。这是基于刑法的谦抑性原则，避免对轻微违法行为过度惩罚。
犯罪已过追诉时效期限：犯罪发生后，经过法定追诉期限，司法机关不能再追诉。此时若案件被撤销，当事人亦无案底。这是为了保障法律的稳定性和可预测性，避免对久远的犯罪行为进行无休止的追诉。
经特赦令免除刑罚：若国家发布特赦令，对特定犯罪人免除刑罚，据此撤销的案件，当事人不会留下案底。特赦是国家对特定犯罪人的宽大处理，体现了国家的仁慈和宽容。
依照刑法告诉才处理的犯罪，未告诉或撤回告诉：此类案件若公安机关撤销，同样不会留下案底。这是因为告诉才处理的犯罪需要被害人主动告诉，如果被害人未告诉或撤回告诉，则视为犯罪行为未被追究。
犯罪嫌疑人、被告人死亡：因犯罪嫌疑人或被告人死亡导致刑事诉讼无法继续，案件撤销后，也不会有犯罪记录。这是因为刑事诉讼的目的是对犯罪嫌疑人或被告人进行审判和惩罚，如果其已经死亡，则无法再进行诉讼。
其他法律规定免予追究刑事责任的：若案件因其他法律规定而免予追究刑事责任并被撤销，同样不会留下案底。这是为了保障法律的灵活性和适应性，避免对特定情况下的犯罪行为进行机械的惩罚。
二、可能留下记录的情况
行政处罚记录：虽然案件被撤销，但若在调查过程中当事人的行为违反了《中华人民共和国治安管理处罚法》等法律法规，并因此受到警告、罚款、行政拘留等行政处罚，会留下违法记录。这种记录与犯罪案底不同，对个人影响相对较小，但仍可能在某些特定场合（如求职、出国等）产生一定影响。
法院判决记录：若案件在进入法院审判程序后，法院作出了有罪判决，即使后来案件被撤销或当事人被赦免，这个有罪判决的记录仍可能保留在司法系统中。这种情况下的“记录”更多是指法院的判决记录，而非公安机关的立案记录。它表明当事人曾经被法院判定有罪，对个人在就业、生活等方面可能产生较大影响。
三、建议与注意事项
了解案件进展：如果您的案件被撤销，建议您向公安机关或检察院了解案件的具体进展和撤销原因，以便更好地了解自己的法律状况。
保留相关证据：如果案件撤销后您担心可能留下不良记录，建议您保留与案件相关的所有证据和文件，以备不时之需。
咨询专业律师：如果您对案件撤销后的法律后果有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总之，刑事案件立案以后撤销，在大多数情况下是不会留下案底的。但需注意，若案件涉及行政处罚或已进入法院审判程序并有罪判决，则可能留下相关记录。因此，在处理法律事务时应谨慎对待，必要时可寻求专业法律帮助。