刑事立案后撤案是否会有案底，主要取决于案件的性质、撤案的阶段以及撤案的具体原因。以下是对这一问题的详细分析：

1. 不构成犯罪的撤案

   • 侦查阶段撤案：在侦查过程中，若公安机关或其他侦查机关发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，如案件属于误会、所谓的“犯罪行为”实际并未发生，或犯罪嫌疑人的行为情节显著轻微、危害不大且不认为是犯罪，应当撤销案件。此情况下，因未认定犯罪嫌疑人构成犯罪，故不会留下案底。

   • 审查起诉阶段撤案：检察机关在审查起诉时，若发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形（如情节显著轻微、危害不大；犯罪已过追诉时效期限等），应作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察院也可作出不起诉决定。这两种不起诉决定均意味着犯罪嫌疑人不会被交付审判，因此不会有犯罪记录，即不会留下案底。但需注意，若是检察院作出的酌定不起诉决定，其不起诉决定书会存入个人档案，可能视为一种特殊记录，不过这并不等同于犯罪案底。

2. 构成犯罪但特殊情况撤案

在某些特定的自诉案件中，若被害人与被告人达成和解协议，被害人主动撤回起诉，且犯罪事实确实存在，只是基于被害人的意愿而撤案，严格来说行为人的行为依然构成犯罪。但由于没有经过法院的有罪判决，从通常所理解的“案底”（即犯罪记录）角度，可能不会在官方的犯罪记录档案中留下记录。然而，司法机关处理案件过程中形成的相关材料可能会有留存。

1. 存在特殊记录的情况

即使案件撤案没有犯罪记录，但在案件办理过程中，若发现有相关的行政违法行为并给予了行政处罚（如罚款、行政拘留等），则会留下行政处罚的记录。这种记录虽不同于犯罪案底，但也属于一种不良记录，可能对个人的未来产生一定影响，比如在求职、政审等环节可能需要额外说明或提供证明材料。

总结与建议：

• 撤案并不意味着完全没有记录，是否留下案底需根据具体情况判断。
• 如果您或您身边的人遇到刑事立案后撤案的情况，且对是否会留下案底有疑虑，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律分析和建议。
• 在日常生活中，我们应遵守法律法规，避免涉及任何违法犯罪行为，以维护自己的良好记录和声誉。