非法制造印刷品的企业主要由出版行政部门和工商行政管理部门进行监管。具体来说：
出版行政部门：根据《印刷业管理条例》的相关规定，出版行政部门负责对印刷经营活动进行监管。对于擅自设立从事出版物印刷经营活动的企业或者擅自从事印刷经营活动的行为，出版行政部门有权依据法定职权予以取缔，并没收印刷品和违法所得以及进行违法活动的专用工具、设备。同时，根据违法经营额的大小，还会处以相应的罚款。
工商行政管理部门：工商行政管理部门同样对非法制造印刷品的企业具有监管职责。在发现擅自设立从事出版物印刷经营活动的企业或者擅自从事印刷经营活动的行为时，工商行政管理部门也会与出版行政部门协同工作，依据法定职权进行取缔，并采取相应的处罚措施。
法律背景与建议：
法律背景：非法制造印刷品不仅违反了《印刷业管理条例》的相关规定，还可能涉及侵犯知识产权、传播违法信息等严重问题。因此，国家对此类行为采取了严格的监管措施。
法律建议：对于企业而言，应当严格遵守国家关于印刷经营活动的法律法规，确保自身的经营活动合法合规。如果发现存在非法制造印刷品的行为，应当及时向出版行政部门或工商行政管理部门举报，以维护市场秩序和公共利益。
可能的法律后果：
如果企业擅自设立从事出版物印刷经营活动或者擅自从事印刷经营活动，将面临被取缔、没收违法所得和专用工具设备、以及处以罚款等法律后果。
如果违法经营额较大，罚款的数额也会相应增加。在极端情况下，如果构成犯罪，还将依法追究刑事责任。
因此，我建议企业在开展印刷经营活动时，务必确保自身的合法性和合规性，避免触犯法律红线。如果有任何关于公司法务方面的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。