在公司上班时脚指头被砸掉一个，应按照工伤赔偿流程进行赔偿。以下是具体的赔偿步骤和注意事项：

一. 及时报告与工伤认定

1. 及时报告：你应立即或尽快将事故报告给用人单位，用人单位应在事故伤害发生之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
2. 个人申请权利：若用人单位未按规定时间申报，你或你的近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
3. 准备材料：包括工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料、医疗机构出具的受伤后诊断证明书等。

二. 医疗救治与费用支付

1. 接受治疗：到指定的医疗机构接受治疗，所有合理的医疗费用，包括治疗工伤的医疗费用和康复费用，将由工伤保险基金支付。
2. 费用范围：涵盖挂号费、诊疗费、住院费、康复费以及符合规定的伙食补助费、交通食宿费等。

三. 停工留薪期待遇

在停工留薪期内，你的原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期的长短需根据伤情和医疗机构出具的意见确定，一般不超过12个月，特殊情况可延长。

四. 劳动能力鉴定与赔偿

1. 伤残鉴定：治疗结束后，若留下残疾，应申请进行劳动能力鉴定（伤残等级鉴定）。
2. 赔偿项目：根据伤残等级，你可获得一次性伤残补助金、伤残津贴（如适用）、生活护理费（如需要）、安装配置伤残辅助器具所需费用等。具体数额和标准依据当地工伤保险政策而定。

五. 争议解决

如果对工伤认定、赔偿金额等有异议，可与用人单位协商。协商不成时，可申请劳动仲裁或通过诉讼途径解决。

我建议你按照上述流程及时报告、申请工伤认定、接受医疗救治，并根据需要进行劳动能力鉴定。在整个过程中，保留好所有相关的证据材料，如医疗记录、工伤认定书、工资单等，以便在需要时维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。