用工单位与派遣公司签订的协议若想合法合规，需重点从协议内容、主体资质、程序合规三个层面进行把控，具体如下：

1. 协议内容合法合规

• 明确派遣岗位与期限：协议中需清晰约定派遣岗位的性质（临时性、辅助性或替代性），避免将核心业务岗位纳入派遣范围（否则可能违反《劳务派遣暂行规定》）。同时，派遣期限不得超过法定上限（如临时性岗位不超过6个月）。
• 费用与责任划分：明确派遣费用构成（如工资、社保、管理费等）及支付方式，避免模糊条款导致纠纷。同时，约定双方在劳动者权益受损时的责任分担（如工伤、欠薪等），建议明确用工单位承担连带责任时的追偿机制。
• 劳动者权益保障：协议需强制要求派遣公司为劳动者缴纳社保、支付加班费，并约定用工单位不得克扣劳动者报酬或要求其从事危险作业。

2. 主体资质合法

• 派遣公司资质：用工单位需核实派遣公司是否持有《劳务派遣经营许可证》，且经营范围包含劳务派遣业务。若派遣公司无资质，协议可能被认定无效，用工单位需承担直接用工责任。
• 用工单位资质：确保用工单位具备合法用工主体资格（如企业营业执照、组织机构代码证等），避免与无资质主体合作。

3. 程序合规

• 民主协商程序：若派遣岗位涉及“辅助性”岗位，用工单位需通过职工代表大会或全体职工讨论，提出方案并与工会协商确定，保留书面记录（否则可能面临行政处罚）。
• 合同签订与备案：协议需采用书面形式，明确双方权利义务。部分地区要求将协议报送劳动行政部门备案（如上海、北京），需按当地规定执行。
• 劳动者知情权：协议中应约定派遣公司需向劳动者如实告知用工单位情况、派遣期限、劳动报酬等信息，避免因信息隐瞒导致协议无效。

4. 其他注意事项

• 禁止“假派遣、真用工”：避免通过派遣协议掩盖直接用工关系（如长期固定岗位使用派遣工），否则可能被认定为事实劳动关系，用工单位需承担雇主责任。
• 协议变更与解除：明确协议变更（如岗位调整）或解除的条件（如派遣公司违约、用工单位业务调整），并约定提前通知期限及违约责任。

建议：协议签订前，双方可委托律师审核条款，确保符合《劳动合同法》《劳务派遣暂行规定》等法规。若遇纠纷，可依据协议约定及法律规定主张权利。如有具体条款设计或合规疑问，可直接向我咨询。