针对“工厂上班不穿厂服扣款合法吗”这一问题，我们可以从以下几个角度进行详细分析：
结论前置
工厂以员工不穿厂服为由扣款是否合法，关键在于工厂规章制度的合法性、明确性以及扣款数额的合理性。若工厂规章制度未经合法程序制定，或扣款数额过高，则此扣款行为很可能不合法。
详细分析
规章制度的合法性
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，涉及劳动者切身利益的规章制度需经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并公示或告知员工。若工厂未在劳动合同、员工手册、规章制度等书面文件中明确规定员工不穿厂服会扣工资，或该规定未经上述合法程序制定，则此扣工资行为属于违法。
扣款数额的合理性
- 即使工厂存在相关规定，但扣取的工资数额若过高，也可能构成违法。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者个人原因造成的经济损失赔偿，每月扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。不穿厂服通常不会直接造成经济损失，因此高额扣款很可能违反上述规定。
工作服的功能性
- 在特定行业或工作环境中，工作服具有功能性作用，如建筑施工、化工生产的防护功能，以及医疗卫生、食品加工的卫生标准要求。若员工不按规定穿着工作服可能对自身或他人健康、安全构成威胁，工厂可以制定相关规定来强化安全意识和责任意识。但即便如此，扣款也需遵循上述合法性和合理性的原则。
员工应对策略
- 查看公司规定：员工应首先了解工厂的相关规章制度，特别是关于着装和扣款的规定。
- 协商解决：如认为扣款不合理，可与工厂进行协商解决。在协商过程中，员工可以提出自己的观点和依据，要求工厂给出合理的解释和依据。
- 法律维权：协商不成时，员工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，员工需要提供相关证据，如工资条、扣款通知、规章制度等，以证明自己的权益受到了侵害。
可能的法律后果
- 若工厂的扣款行为被认定为违法，工厂可能需要向员工支付被扣的工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。
- 若员工因不穿厂服而给工厂造成实际经济损失（如因未穿防护服导致工伤事故），且工厂有合法有效的规章制度作为依据，则工厂可能要求员工承担相应的赔偿责任。但这种情况下的赔偿也需遵循合法性和合理性的原则。
综上所述，工厂以员工不穿厂服为由扣款是否合法，需根据具体情况来判断。员工在面临此类问题时，应了解自己的权益，并采取适当的措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。