若投标中两个商家法人存在关联，需根据关联关系的性质及招标文件要求来处理，核心结论如下：

1. 核查招标文件是否禁止关联方投标
   多数招标项目会明确禁止存在直接控股、管理关系或可能影响公平竞争的关联方同时投标。若招标文件有此类规定，两个关联商家需选择其中一方参与，或通过股权结构调整、管理权变更等方式消除关联关系，否则可能因“围标”“串标”被取消资格。

2. 若招标文件未禁止，需主动披露关联关系
   即使招标文件未明确限制，关联商家仍需在投标文件中如实披露法人关联情况（如股权比例、任职关系等），并承诺投标过程独立、报价公正。未披露可能导致中标后被认定“隐瞒重要信息”，合同可能被撤销或承担违约责任。

3. 从法律风险角度，需避免“串通投标”嫌疑
   根据《招标投标法》第五十三条，若关联商家通过协商报价、轮流中标等方式操纵投标，可能被认定为“串通投标”，面临罚款、没收投标保证金、取消一至三年内投标资格等处罚，情节严重者可能追究刑事责任。

实务建议：

• 投标前仔细研读招标文件，重点关注“投标人资格条件”“禁止性规定”等条款；
  
• 若存在关联，优先与招标方沟通确认是否允许参与，并留存书面沟通记录；
  
• 投标文件中关联关系披露需具体（如附股权结构图、法人任职证明），避免模糊表述。
  

如有具体招标文件条款或关联情形需分析，可直接提供细节进一步咨询。