建设违章建筑，不影响建设工程合同的效力。具体分析如下：

一. 建设违章建筑与合同效力的关系

1. 合同效力独立：建设工程合同的效力，主要依据《民法典》的相关规定来判断，如合同主体是否具备相应的民事行为能力，合同内容是否合法、是否违反法律强制性规定等。而建设违章建筑，主要违反的是城乡规划、土地管理等行政法规，这并不影响合同本身的效力。
2. 违章建筑的后果：虽然建设违章建筑不会导致合同无效，但违章建筑本身可能面临被拆除、罚款等行政处罚。这些后果主要由建设单位或施工单位承担，与合同效力无直接关联。

二. 法律依据

• 《民法典》第一百四十三条：具备下列条件的民事法律行为有效：（一）行为人具有相应的民事行为能力；（二）意思表示真实；（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
• 《民法典》第一百五十三条：违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效，但是该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。此处“不导致无效的除外”即指，如果法律、行政法规的强制性规定并非直接针对合同效力，而是针对合同履行或合同标的物的，则不影响合同的效力。

三. 实例说明

• 例如，甲公司与乙公司签订了一份建设工程合同，约定由乙公司为甲公司建设一栋楼房。但在建设过程中，乙公司未按照规划许可进行建设，导致该楼房成为违章建筑。此时，虽然该楼房作为合同标的物存在违法性，但甲公司与乙公司之间签订的建设工程合同仍然有效。双方仍需按照合同约定履行各自义务，如支付工程款、完成工程施工等。当然，对于违章建筑本身，相关部门将依法进行处理。

综上所述，建设违章建筑并不会导致建设工程合同无效。但需要注意的是，违章建筑可能面临的法律后果仍需由相关责任方承担。如有进一步需要，您可以继续咨询我。