关于低保户是否可以签合作协议以及其合法性的问题，这主要取决于合作协议的具体内容、目的以及低保户自身的民事行为能力。
首先，我们要明确的是，低保户作为公民，享有与其他公民同等的民事权利，包括签订合同或协议的权利。但是，这种权利并不是无限制的，它受到低保户自身民事行为能力以及合作协议内容合法性的约束。
民事行为能力：
- 如果低保户是完全民事行为能力人（即能够独立进行民事活动，承担民事责任的人），那么他们有权签订任何合法的合作协议。
- 如果低保户是限制民事行为能力人或无民事行为能力人（如未成年人、精神病人等），则他们签订的合作协议可能需要经过其法定代理人的同意或追认才有效。
合作协议内容合法性：
- 合作协议的内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害国家、集体、第三人的利益。
- 如果合作协议涉及低保户享受的低保待遇或相关福利，需要特别注意是否违反了低保政策的相关规定。例如，如果合作协议要求低保户放弃或转让其低保待遇，那么这种协议很可能是无效的。
低保政策的影响：
- 低保政策旨在保障困难群众的基本生活，因此低保户在签订合作协议时，需要确保该协议不会影响其享受低保待遇的资格或条件。
- 如果合作协议导致低保户的家庭收入或财产状况发生变化，可能影响其低保资格的，低保户应及时向相关部门报告并申请重新评估。
结论：
低保户在具备完全民事行为能力且合作协议内容合法、不违反低保政策规定的前提下，是可以签订合作协议的。但是，在签订前务必仔细阅读协议条款，确保自己的权益不受损害，并咨询相关部门或法律专业人士的意见。如果合作协议涉及低保待遇或相关福利的变更，建议先向当地民政部门咨询并获得批准后再进行签订。