结论：甲方公司以个人名义签订发包合同，在法律上存在合规风险，是否合法需结合具体情形判断。以下从不同角度展开分析：

1. 合同主体资格的合法性

根据《民法典》第四百九十条，合同生效需满足“行为人具有相应的民事行为能力”。若个人以公司名义签订合同，可能涉及以下问题：

• 表见代理风险：若个人无公司授权，但相对方有理由相信其有代理权（如持有公司公章、合同书等），可能构成表见代理，公司需承担合同责任。
• 无权代理后果：若个人无代理权且相对方明知，合同对公司不发生效力，由个人承担责任。但若公司事后追认，则合同对公司生效。
• 公司人格否认风险：若个人以公司名义签订合同，但实际为个人利益（如规避债务、转移资产），可能被认定为“滥用公司法人独立地位”，导致公司股东对公司债务承担连带责任。

2. 合同效力的实质审查

合同效力需结合《民法典》第一百四十三条判断：

• 行为人具有相应行为能力：个人以公司名义签约，若个人无公司授权，可能因“无权代理”导致合同效力待定。
• 意思表示真实：若个人隐瞒公司身份，以个人名义签约但实际履行公司义务，可能因“虚假意思表示”被认定无效。
• 不违反法律、行政法规强制性规定：若合同内容涉及违法发包（如未取得建设工程规划许可证），即使以个人名义签约，合同仍可能因违法而无效。

3. 实务中的风险点

• 税务合规风险：个人以公司名义签约，可能导致发票开具主体与合同主体不一致，引发税务稽查风险。
• 劳动用工风险：若发包合同涉及劳务分包，个人以公司名义签约但未签订书面劳动合同，可能被认定为事实劳动关系，公司需承担用工责任。
• 行政处罚风险：若发包行为违反《建筑法》等强制性规定（如未取得施工许可证），即使以个人名义签约，公司仍可能面临行政处罚。

4. 合规建议

• 明确合同主体：公司应直接以自身名义签订合同，避免个人代签。
• 完善授权手续：若需个人代签，应出具书面授权委托书，明确代理权限、期限及范围。
• 审查合同内容：确保合同内容不违反法律强制性规定，避免因违法导致合同无效。
• 保留履约证据：在合同履行过程中，保留与合同相关的往来函件、付款凭证等证据，以备纠纷时举证。

总结：甲方公司以个人名义签订发包合同，法律上存在合规风险，是否合法需结合具体情形判断。建议公司直接以自身名义签约，或完善授权手续，避免因主体不适格导致合同效力争议。如有具体案件，可进一步提供细节，我将为您深入分析。