公司和员工以个人名义签协议，在满足一定条件下是合法的。具体来说：

1. 主体合格：公司需是依法成立并具有合法经营资格的主体，员工需达到法定就业年龄并具备相应的民事行为能力和劳动能力。

2. 意思表示真实：协议的签订必须基于双方在平等、自愿、公平的基础上真实表达自己的意愿，不存在欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情形。

3. 内容合法合规：协议内容不得违反法律法规的强制性规定，不得损害国家利益、社会公共利益及第三人的合法权益。同时，协议应明确双方的权利义务，如工作时间、劳动报酬、社会保险等，并应符合相关法律法规的要求。

4. 形式符合要求：劳动合同等关键协议应采用书面形式，并可能需要满足盖章、签字、备案等特定形式要件以确保其法律效力。

然而，也需要注意以下特殊情况：

• 如果协议中约定了违反法律法规强制性规定的内容，如工资低于最低工资标准、要求员工自行承担工伤医疗费用等，这些条款将因违法而无效。
• 如果公司存在欺诈、胁迫等不正当手段，导致员工在违背真实意思的情况下签订协议，那么这份协议可能会被视为无效。
• 协议内容如果显失公平，严重损害员工合法权益，员工也有权请求撤销。

因此，公司在与员工签订协议时，应确保协议的合法性、公平性和有效性，避免潜在的法律风险。如果员工对协议内容有任何疑问或不满，应及时与公司沟通并寻求解决方案。同时，员工也应了解自己的权益和义务，确保在签订协议时能够做出明智的选择。