个人跟公司签合作协议是完全合法的。在商业活动中，个人与公司作为平等的民事主体，基于真实意思表示，完全可以签订合作协议来明确双方在特定项目或业务中的权利、义务和责任。以下从多个角度为你详细分析：
法律依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定：
合同定义与适用范围：合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。个人与公司之间的合作协议，作为合同的一种，同样受《民法典》的调整和保护。
协议有效的一般条件：
合同订立的形式：当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或其他形式。书面形式包括合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。电子数据交换、电子邮件等能够有形地表现所载内容并可随时调取查用的数据电文，也视为书面形式。因此，个人与公司签订合作协议时，应选择合适的形式以确保协议的效力。
合作协议的关键要素
为了确保合作协议的合法性和有效性，以下关键要素应当明确：
合作的具体内容和目的：详细描述合作的项目、目标及期望达成的成果，确保双方对合作有清晰的认识和共同的期望。
双方的权利和义务：明确各自在合作中应承担的责任和享有的权益，这是合作协议的核心部分，也是保障双方权益的基础。
合作期限：约定合作的有效期，包括开始日期和结束日期，以及可能的续签或提前终止条件，以便双方对合作的时间框架有明确的了解。
收益分配方式：如果合作涉及经济收益，应明确收益的分配比例、方式和时间，以避免未来产生纠纷。
保密条款：对于可能涉及的商业秘密或敏感信息，应设定相应的保密义务，以保护双方的商业利益。
违约责任：规定任何一方违反协议时应承担的法律责任，以增强协议的约束力和执行力。
争议解决机制：约定在发生争议时的解决途径，如协商、调解、仲裁或诉讼等，以便在出现问题时能够迅速有效地解决。
实际操作中的注意事项
审查对方资质：在签订合作协议前，应审查对方的资质和信誉，确保对方具备履行协议的能力。
明确协议条款：协议条款应具体、明确，避免使用模糊或歧义的表述，以减少未来可能出现的争议。
咨询专业意见：虽然我已经为你提供了详细的法律分析，但在实际操作中，如果合作协议涉及复杂或高风险的法律问题，建议向我进一步咨询，以确保协议的合法性和有效性。
可能的法律后果
如果合作协议的内容违反法律法规的强制性规定，或者损害国家利益、社会公共利益和他人的合法权益，该协议可能被视为无效。此外，如果一方违反协议约定，另一方可以依据协议和相关法律规定追究其违约责任，包括要求赔偿损失等。
总结来说，个人跟公司签合作协议是完全合法的，但双方在签订时应谨慎考虑并明确各项关键要素，以确保合作的顺利进行并维护各自的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。