在登记经营者和实际经营者不一致的情况下，举证责任主要落在主张权利的一方，即通常是需要证明实际经营者与登记经营者不一致，以及由此产生的相关责任或权益受损情况的原告方。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、举证责任的一般原则
在民事诉讼中，举证责任通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。因此，当登记经营者和实际经营者不一致时，如果原告方（如债权人、合同相对方等）主张实际经营者应承担责任，或者登记经营者与实际经营者应共同承担责任，那么原告方需要承担举证责任，证明实际经营者的存在以及其与登记经营者之间的不一致性。
二、具体举证内容
证明实际经营者的存在：
- 原告方需要提供证据证明实际经营者的身份，如实际经营者与登记经营者之间的协议、合作合同、托管协议等。
- 还可以通过其他间接证据，如交易记录、付款凭证、沟通记录等，来证明实际经营者在经营过程中的作用。
证明登记经营者与实际经营者的不一致性：
- 原告方需要证明登记经营者并未实际参与经营，或者其参与经营的程度与实际经营者不符。
- 这可以通过对比登记经营者和实际经营者在经营过程中的行为、决策、财务等方面的差异来实现。
证明权益受损或责任产生：
- 原告方还需要证明由于登记经营者与实际经营者的不一致性，导致其权益受损或产生了相应的责任。
- 这可以通过提供损失计算依据、责任认定依据等证据来实现。
三、法律后果与责任承担
共同承担责任：
- 根据相关法律规定和司法实践，当登记经营者和实际经营者不一致时，如果相对人（如原告方）并非因自身过错而不知或不应知登记经营者与实际经营者不符，则应认定为善意。
- 在此情况下，基于合同相对方对工商字号的信赖利益，登记经营者和实际经营者应当共同对个体工商户的债务承担连带清偿责任。
内部责任划分：
- 登记经营者在对外承担连带责任后，可以根据其与实际经营者的内部约定理清其应承担的责任。
- 但需要注意的是，这种内部约定不得对抗第三人，即不能作为对抗原告方主张权利的依据。
四、实际案例中的举证责任
在实际案例中，如某度假村与李某某的租赁经营纠纷中，原告方通过提供装修合同、工程施工协议书、鉴定意见书等证据，证明了实际经营者李某某的存在以及其与登记经营者某度假村之间的不一致性。同时，原告方还通过提供工程款支付记录等证据，证明了其权益受损的情况。最终，法院根据这些证据判决李某某和某度假村共同承担责任。
五、建议与注意事项
保留证据：
- 在经营过程中，各方应妥善保留与经营相关的证据，如合同、协议、交易记录、付款凭证等。
- 这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
依法登记与经营：
- 实际经营者应依法办理登记手续，避免因权责不清而面临不必要的法律风险。
- 登记经营者在允许他人使用其营业执照开展经营活动时，也应保持高度审慎，充分评估由此可能产生的法律风险。
及时咨询专业律师：
- 在发生纠纷或面临法律风险时，应及时咨询专业律师以获取专业的法律建议和帮助。
作为马海东律师，我擅长处理医疗纠纷、医疗事故赔偿、医疗事故鉴定、医疗损害、合同纠纷、公司事务、建设工程、合同订立等领域的法律问题。如果您在此类问题上遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。