结论：个体工商户将合同中规定的小商品三个字涂改成小面馆以办理执照的行为，可能构成违法，具体取决于涂改行为的性质、目的以及是否违反了相关法律法规。
一、涂改合同内容的法律性质
合同变更需双方同意：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的变更应当经当事人协商一致。如果个体工商户未经合同另一方同意，擅自涂改合同内容，这种行为可能构成违约，甚至可能构成欺诈或篡改证据等违法行为。
涂改可能影响合同效力：
- 涂改合同内容可能改变合同的原意，导致合同条款不明确或产生歧义，进而影响合同的效力。如果涂改后的内容与合同原意相悖，或者涂改行为导致合同无法履行，那么涂改行为可能被视为无效或可撤销。
二、涂改行为对办理执照的影响
执照申请需真实材料：
- 办理营业执照需要提交真实、准确、完整的申请材料。如果个体工商户通过涂改合同内容来虚构经营项目或范围，以获取不符合其实际经营情况的营业执照，这种行为可能构成提供虚假材料或隐瞒重要事实，从而违反相关法律法规。
可能面临的法律后果：
- 如果涂改行为被认定为违法，个体工商户可能面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。同时，如果涂改行为导致合同另一方遭受损失，个体工商户还可能承担民事赔偿责任。
三、具体建议
立即停止涂改行为：
- 如果个体工商户已经涂改了合同内容，应立即停止这种行为，并尽快与合同另一方协商，就合同变更事宜达成一致意见。
重新申请或变更执照：
- 如果个体工商户希望变更经营项目或范围，应按照相关法律法规的规定，重新提交真实、准确的申请材料，或者通过合法途径变更营业执照。
寻求法律帮助：
- 如果个体工商户对涂改行为的法律性质或后果存在疑问，或者已经因此面临法律纠纷，应及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身合法权益。
总结：个体工商户将合同中规定的小商品三个字涂改成小面馆以办理执照的行为，可能构成违法。这种行为不仅可能影响合同的效力，还可能导致行政处罚和民事赔偿责任。因此，建议个体工商户立即停止涂改行为，并按照相关法律法规的规定重新申请或变更执照。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。