行政处罚案件中，违法所得无法查清并不直接等同于认定无违法所得，而是需根据具体法律法规和案件情况来综合判断。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律法规的具体规定
《行政处罚法》的相关规定：
- 新修订的《行政处罚法》第二十八条第二款规定，违法所得指实施违法行为所取得的款项。这表明，违法所得的认定是市场监管部门执法中的重要环节。
- 同时，法律、行政法规、部门规章对违法所得的计算另有规定的，从其规定。这意味着，在计算违法所得时，需遵循相关法律法规的具体规定。
其他法律法规的裁量规定：
- 如《消费者权益保护法》第五十六条、《广告法》第五十五条以及《价格违法行为行政处罚规定》等，均针对违法行为是否有违法所得或违法所得无法计算的情况，作出了不同的裁量规定。
- 例如，《价格违法行为行政处罚规定》第十八条明确，本规定中以违法所得计算罚款数额的，违法所得无法确定时，按照没有违法所得的规定处罚。
二、违法所得无法查清的处理方式
主观不能与客观不能：
- 违法所得无法查清可能分为主观不能和客观不能。主观不能指当事人不提供或不如实提供资料，致使违法所得难以确认；客观不能则指由于证据缺失等原因，导致违法所得无法计算。
- 对于主观不能的情况，当事人或相关人员有义务如实回答询问并协助调查，否则可能面临法律后果。
按无违法所得处理的情形：
- 在某些法规和执法指南中，明确规定了违法所得难以计算时，按无违法所得处理。例如，《上海市物价局关于查处价格欺诈等违法行为的执法指南》就有此类规定。
- 此外，总局《市场监督管理行政处罚案件违法所得认定办法》的相关稿件也提出了类似观点，但具体表述可能因版本不同而有所差异。
三、违法所得与处罚幅度的关系
违法所得对处罚幅度的影响：
- 违法所得的有无及多少，往往直接影响处罚的幅度。例如，在某些法律法规中，有违法所得的，处罚幅度可能以违法所得为基准；无违法所得的，则直接规定罚款幅度。
- 这可能导致在一定区间内，无违法所得的罚款高于有违法所得的罚款，出现违法情形与罚款程度“倒挂”的情形。
调整建议：
- 针对上述问题，有学者和实践者提出调整违法所得与处罚金额认定的方式。例如，参考《食品安全法》对于违法所得（货值金额）与处罚幅度上的关系，根据不同的违法所得认定不同的处罚额度区间。
- 同时，强化违法行为证据的支撑和其他行政手段的制约也是必要的。例如，对于单次违法所得较小的案件，应强化对当事人前期行为的调查；对于首次违法、情节轻微且无违法所得的，可按照轻微违法行为不予行政处罚的规定处理。
四、实际操作中的注意事项
全面收集证据：
- 在案件调查中，办案人员应尽可能全面收集证据，形成证据链，以准确计算违法所得。避免仅凭当事人口述来确定违法所得。
遵循法律法规：
- 在处理违法所得无法查清的情况时，应严格遵循相关法律法规的规定，确保行政处罚的合法性和合理性。
总结来看，行政处罚案件中违法所得无法查清并不直接等同于认定无违法所得。而是需根据具体法律法规和案件情况来综合判断，并遵循相关法律法规的规定进行处理。在实际操作中，办案人员应全面收集证据、准确计算违法所得，并确保行政处罚的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。