公司制度不合法，员工离职后一般不需要承担责任。但具体情况需根据员工是否参与违规操作、违规操作的性质和后果来判断。以下是详细分析：
一. 员工未参与公司违规操作
如果员工在离职前并未参与公司违规操作，且公司的制度不合法并未对员工造成直接损害，那么在离职后，员工就不需要为公司的违规操作承担责任。因为员工与公司的劳动关系已经终止，公司的后续行为与员工无关。
二. 员工参与公司违规操作
违反保密义务或竞业限制
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条，如果员工在离职前违反了劳动合同中的保密义务或者竞业限制，并且给用人单位造成了损失，那么员工需要承担赔偿责任。即使员工已经离职，也不能免除其赔偿责任。
参与违法活动
- 若员工在职期间参与了公司的违法活动，如违反法律、行政法规或公司章程的规定，且这些违规操作给公司造成了损失，那么员工可能需要承担赔偿责任。这种责任并不因员工的离职而消失。根据《中华人民共和国刑法》第十四条，故意犯罪应当负刑事责任。对于涉及违法行为的离职员工，法律追诉通常取决于能否收集到充分证据来证明其个人责任。
三. 员工被迫离职的情况
- 如果公司存在未依法支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险、用人单位的规章制度违反法律法规损害劳动者权益等违法情形，员工以此为由解除劳动合同（离职），员工没有责任，并且员工有权要求公司支付经济补偿金。
我的建议：在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，如劳动合同、工资单、离职证明等，以便在必要时维护自己的权益。同时，员工在离职前应尽量与公司协商解决争议，避免不必要的法律纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。