针对您提出的“公司被别人非法使用了怎么办”这一问题，我首先明确结论：您应当立即采取措施，保护公司的合法权益，防止损失进一步扩大。接下来，我将从多个角度为您详细分析并给出建议。

1. 确认非法使用的事实：

   • 您需要收集并整理所有能够证明公司被非法使用的证据，包括但不限于合同、协议、邮件、聊天记录、财务记录等。这些证据将用于后续的法律程序，以证明对方的非法行为。

2. 评估损失与影响：

   • 对公司因非法使用而遭受的损失进行全面评估，包括直接经济损失（如资金流失、业务中断等）和间接经济损失（如品牌声誉受损、客户流失等）。这将有助于您在后续的法律程序中主张赔偿。

3. 采取法律措施：

   • 发送律师函：首先，您可以委托我作为您的律师，向非法使用者发送律师函，要求其立即停止非法行为，并赔偿因此给公司造成的损失。律师函具有法律效应，能够迫使对方正视问题并采取行动。
   • 提起诉讼：如果对方拒绝配合或继续非法使用，您可以考虑向法院提起诉讼，要求法院确认对方的非法行为，并判决其承担相应的法律责任和赔偿责任。在诉讼过程中，我将代表您出庭，维护公司的合法权益。

4. 加强内部管理：

   • 同时，您也需要对公司内部进行审查，查找是否存在管理漏洞或安全隐患，导致公司被非法使用。加强内部管理，完善制度建设，是防止类似事件再次发生的关键。

5. 考虑报警：

   • 如果对方的非法使用行为涉嫌犯罪（如诈骗、侵占等），您还可以考虑向公安机关报案，要求追究其刑事责任。

6. 后续跟进与预防：

   • 在采取法律措施后，您需要持续跟进案件进展，确保公司的合法权益得到充分保护。同时，您也需要总结经验教训，加强公司的风险防范意识，预防类似事件再次发生。

综上所述，面对公司被非法使用的情况，您应当立即采取措施，保护公司的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议和服务。