针对您提出的问题，即公务员病亡后抚恤金已领取，但其亲生儿子在之后才确定亲子关系，是否还能补申请遗属补助，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确遗属补助的发放原则和范围。遗属生活困难补助的发放，主要是为了帮助那些依靠死亡者生前供养的直系亲属和其他人员解决生活困难。其发放范围通常包括父（母）、夫（妻）年满一定年龄或基本丧失劳动能力的，以及子女年龄未满一定年龄或尚在大中专、技工（职业高中）学校学习，或者基本丧失劳动能力的等情况。
对于您的情况，关键在于确定您的儿子是否符合遗属补助的发放条件。根据相关规定，子女（包括遗腹子女、养子女、前妻或前夫所生子女）在年龄未满16周岁或虽已满16周岁但尚在大中专、技工（职业高中）学校学习，或者基本丧失劳动能力的条件下，是可以享受遗属生活困难补助的。
然而，您提到的是在公务员病亡后，抚恤金已经领取，而其亲生儿子在之后才确定亲子关系。这种情况下，是否还能补申请遗属补助，需要具体看当地的政策和规定。一般来说，如果亲子关系在公务员病亡后确定，且您的儿子符合遗属补助的发放条件（如年龄、学习状况等），那么理论上是有可能补申请遗属补助的。
但实际操作中，可能还需要考虑一些其他因素，比如：
时间限制：有些地方可能对遗属补助的申请有时间限制，超过一定时间可能无法补申请。
证明材料：需要提供充分的证明材料来证明亲子关系以及您的儿子符合遗属补助的发放条件。
政策差异：不同地区的政策可能存在差异，需要具体了解当地的政策规定。
因此，我建议您：
咨询当地相关部门：直接联系当地的人力资源和社会保障部门或公务员管理部门，了解具体的政策和规定。
准备相关证明材料：如果可能的话，提前准备好亲子关系证明、儿子的年龄和学习状况证明等相关材料。
及时申请：如果符合条件且政策允许，应尽快提交申请，以免错过申请时间。
综上所述，虽然公务员病亡后抚恤金已经领取，但其亲生儿子在之后确定亲子关系的情况下，是否还能补申请遗属补助需要具体看当地的政策和规定。我建议您及时咨询当地相关部门并准备相关证明材料以进行申请。