针对您提出的“公司破产厂房拍卖有租赁合同怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

当公司进入破产程序，并且其厂房面临拍卖时，若存在租赁合同，处理方式需根据具体情况和相关法律规定来确定。

首先，我们要明确的是，在企业进入破产程序但尚未宣告破产时，管理人（通常由法院指定）有权根据《企业破产法》的相关规定，决定是否继续履行租赁合同。这一决定是基于对破产财产最大化利用和债权人利益保护的考虑。

1. 若管理人决定继续履行租赁合同：

   • 租赁关系将继续维持，承租人可以继续使用厂房，并按照原租赁合同支付租金。
   • 管理人将代表破产企业接受承租人的履行，并确保租金等款项用于破产财产的分配。

2. 若管理人决定解除租赁合同：

   • 租赁合同将终止，承租人需要腾退厂房。
   • 承租人因合同解除而遭受的损失，可以作为普通债权向破产管理人申报，并在破产财产分配中得到一定程度的清偿（但具体清偿比例和顺序需根据破产法规定和债权人会议决议确定）。

接下来，当企业宣告破产，厂房被拍卖时，租赁合同的处理还需考虑“买卖不破租赁”的原则：

• 若租赁在前，拍卖在后：

  • 根据“买卖不破租赁”原则，新所有权人（即厂房的买受人）应继续履行原租赁合同，承租人可以继续使用厂房直至合同期满。
  • 新所有权人无权要求承租人提前腾退，除非承租人同意或存在其他法定解除事由。

• 若租赁在后，拍卖在前（但这种情况在实际操作中较为罕见，因为通常租赁合同会在企业正常运营期间签订）：

  • 新所有权人有权要求承租人腾退厂房，因为租赁合同签订时企业已进入破产程序或即将进入，承租人应知晓这一风险。
  • 承租人可向破产管理人主张因合同无法继续履行而造成的损失赔偿，但需结合实际证据判断租赁时间先后及各方权利义务。

针对您提到的具体案例，若在企业进入破产程序但未宣告破产时，管理人决定解除租赁合同，则租赁合同应终止，承租人可申报因合同解除造成的损失为普通债权。之后企业宣告破产，厂房被拍卖，若租赁在前，新所有权人应继续履行原租赁合同；若租赁在后（尽管这种情况较少见），新所有权人有权要求承租人腾退，承租人可向破产管理人主张赔偿。

综上所述，处理公司破产厂房拍卖时存在的租赁合同问题，需根据企业破产程序的具体阶段、管理人的决定以及“买卖不破租赁”原则来综合判断。希望这一解答能为您提供清晰的指导。