关于医院科主任二次分配多拿补助是否违法的问题，需要从多个角度进行分析：
从医院内部规章制度的角度：
- 如果医院有明确的二次分配制度，并且科主任在分配过程中违反了这一制度，多拿了补助，那么这种行为首先违反了医院的内部规定。医院可以根据其内部规章制度对科主任进行相应的处理，如警告、罚款、调整职务等。
- 然而，仅仅违反医院内部规章制度并不直接等同于违法。违法通常指的是违反了国家法律法规的行为。
从劳动法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则与劳动者订立劳动合同，并履行劳动合同约定的义务。
- 如果科主任多拿补助的行为导致了其他劳动者权益的受损，或者违反了劳动法律法规中关于工资分配、福利待遇等方面的规定，那么这种行为可能构成违法。例如，如果科主任利用职务之便，未经合法审批程序，擅自给自己多发补助，就可能构成对其他劳动者权益的侵害。
从刑事法律的角度：
- 在某些情况下，如果科主任多拿补助的行为涉及到了职务侵占、贪污等犯罪行为，那么这种行为就可能构成犯罪。职务侵占罪通常指的是公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。
- 然而，要构成职务侵占罪，需要满足一定的条件，如行为人必须是公司、企业或其他单位的人员，利用了职务上的便利，非法占有了本单位财物，且数额较大等。因此，并不是所有科主任多拿补助的行为都会构成职务侵占罪。
法律建议：
- 如果您认为科主任多拿补助的行为违反了医院内部规章制度或劳动法律法规，您可以先与医院相关部门进行沟通，要求其按照规定进行处理。
- 如果沟通无果，或者您认为科主任的行为已经构成了违法甚至犯罪，您可以向当地劳动行政部门或公安机关进行举报或投诉。
- 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据，如医院二次分配制度、科主任多拿补助的凭证等，以便在需要时提供证明。
总之，医院科主任二次分配多拿补助是否违法，需要根据具体情况进行判断。如果您有此类法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。