关于没收的过期农药处理依据，主要遵循的是《农药管理条例》的相关规定。以下是对这一问题的详细解答：

首先，根据《农药管理条例》第二十三条的规定，对于超过质量保证期限的农药产品，处理方式有明确的规定。如果这些过期农药经过省级以上人民政府农业行政主管部门所属的农药检定机构检验后，仍然符合相关标准，那么它们可以在规定的期限内进行销售。但需要注意的是，销售时必须明确标注“过期农药”字样，并附上详细的使用方法和用量说明，以确保使用者能够安全、有效地使用这些农药。

然而，如果农药企业对超过质量保证期限且未经检验合格的农药产品进行返工处理，比如更换包装并标注新的生产日期等行为，这种行为将被认定为生产失去使用效能的劣质农药。根据《农药管理条例》第四十三条的规定，对于生产、经营劣质农药的行为，将依法进行处罚，包括但不限于没收违法所得、违法经营的农药以及用于违法经营的工具、设备等，并可能处以罚款；情节严重的，还可能吊销农药生产许可证、农药经营许可证等。

在实际操作中，如果发现有过期农药被没收，相关部门会依据上述法规进行妥善处理。对于符合标准的过期农药，可能会在严格监管下进行销售，并确保使用者能够获得充分的信息；而对于不符合标准或经过非法返工处理的过期农药，则会依法进行销毁或其他处理，以防止其流入市场，危害农业生产和生态环境。

综上所述，没收的过期农药处理依据主要是《农药管理条例》的相关规定，旨在确保农药市场的规范和安全，保护农业生产和生态环境。