针对“三个月违法工资怎么处理”这一问题，核心前提是存在违法支付工资的情况，且涉及的时间跨度为三个月。以下是我的详细解答：

1. 首先明确违法工资的性质：

   • 违法工资可能指的是未按照劳动合同约定或国家法律法规规定的标准支付的工资，如低于最低工资标准、未支付加班费、未依法缴纳社会保险费等导致的工资差额。

2. 处理方式：

   • 协商解决：劳动者可以首先尝试与用人单位进行协商，要求补发违法扣除的工资或支付应得的工资差额。这是最直接且成本较低的解决方式。
   • 劳动监察投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门对用人单位进行调查，并责令其支付违法扣除的工资或工资差额。
   • 劳动仲裁：劳动者还可以选择向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付违法扣除的工资或工资差额，并可能获得额外的赔偿（如经济补偿金等，具体根据案件情况而定）。
   • 法律诉讼：如果对仲裁结果不满意，劳动者还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

3. 注意事项：

   • 劳动者在处理此类问题时，应保留好相关证据，如劳动合同、工资条、加班记录等，以便在协商、投诉、仲裁或诉讼过程中证明自己的权益。
   • 劳动者应注意时效问题，根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。

4. 针对三个月的时间跨度：

   • 如果违法工资的情况持续了三个月，劳动者在处理时应将这三个月的工资情况一并考虑，要求用人单位补发这三个月的违法扣除工资或支付工资差额。

综上所述，对于“三个月违法工资怎么处理”的问题，劳动者可以通过协商、劳动监察投诉、劳动仲裁或法律诉讼等方式来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。