关于“发生违规行为考核工资会扣吗”这一问题，结论是：这取决于用人单位的具体规章制度以及违规行为的性质和严重程度。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 用人单位规章制度：

   • 许多用人单位会在其规章制度中明确规定，员工发生违规行为时，可能会受到包括扣减考核工资在内的处罚。这些规章制度通常会在员工入职时进行告知，并要求员工签署确认。
   • 如果用人单位的规章制度中明确规定了违规行为与扣减考核工资之间的关联，且该规章制度合法有效（即不违反法律法规的强制性规定，且已通过民主程序制定并向员工公示），那么用人单位在员工发生违规行为时，有权按照规章制度扣减其考核工资。

2. 违规行为的性质和严重程度：

   • 违规行为的性质和严重程度也是决定是否扣减考核工资的重要因素。一般来说，对于轻微违规行为，用人单位可能会采取警告、罚款等较轻的处罚措施；而对于严重违规行为，如违反安全生产规定、造成重大经济损失等，用人单位则可能会采取更严厉的处罚措施，包括扣减考核工资甚至解除劳动合同。
   • 在判断违规行为的性质和严重程度时，用人单位通常会综合考虑违规行为的具体情况、对用人单位造成的影响以及员工的过往表现等因素。

3. 法律法规的限制：

   • 尽管用人单位有权在规章制度中规定扣减考核工资的条款，但这些条款必须符合法律法规的强制性规定。例如，《劳动法》和《劳动合同法》等法律法规对用人单位的工资支付义务进行了明确规定，用人单位不得随意扣减员工的工资。
   • 如果用人单位的规章制度中关于扣减考核工资的条款违反了法律法规的强制性规定，或者用人单位在扣减考核工资时未遵循法定程序（如未提前告知员工、未听取员工申辩等），那么员工有权向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起申诉或诉讼，要求用人单位补发被扣减的工资并承担相应的法律责任。

法律建议：

• 作为员工，应当了解并遵守用人单位的规章制度，避免发生违规行为。如果确实发生了违规行为，应当积极与用人单位沟通，了解处罚措施并争取从轻处理。
• 如果用人单位扣减了您的考核工资且您认为该扣减行为不合法或不合理，您可以向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起申诉或诉讼，要求用人单位补发被扣减的工资并承担相应的法律责任。
• 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据（如规章制度、违规行为记录、扣减工资通知等），以便在需要时提供证明。

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