员工与企业签订工伤赔偿协议后诉讼是否合法，这并非一个绝对的是非问题，而是需要根据协议签订时的具体情况以及协议内容是否合法、公平来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 协议有效且不可起诉的情形：

   • 当赔偿协议是在双方自愿、平等、公平的基础上签订的，且协议内容不违反法律法规的强制性规定时，该协议通常具有法律约束力。在此情况下，双方应按照协议履行各自的义务，起诉可能不会得到法院的支持。例如，员工在充分了解自己的工伤权益和赔偿标准后，与企业协商一致并签订了赔偿协议，且企业已按协议支付了赔偿款，则此协议对双方均具有约束力。

2. 协议可起诉且可能无效或可撤销的情形：

   • 存在欺诈、胁迫情形：若企业通过欺诈、胁迫等手段使员工在违背真实意思的情况下签订赔偿协议，受欺诈、胁迫方有权请求法院撤销该协议，并通过诉讼要求按照法定标准进行赔偿。例如，企业故意隐瞒工伤的严重程度或误导员工对赔偿标准的认识，导致员工签订了不合理的赔偿协议，员工发现后可起诉要求撤销协议并重新获得合理赔偿。
   • 显失公平：若赔偿协议的内容明显对一方不公平，严重违背了公平、等价有偿的原则，受损方可以在法定期间内请求法院变更或撤销该协议，并主张合理的赔偿。例如，员工因工伤导致终身残疾，但赔偿协议中给予的赔偿金额极低，不足以维持其基本生活和后续治疗，此时协议可能被认定为显失公平，员工可以起诉要求调整赔偿金额。
   • 协议内容违反法律法规强制性规定：若赔偿协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，如约定的赔偿金额低于法定的工伤赔偿标准或排除了员工依法应享有的某些工伤待遇，则该协议可能被认定为无效。员工可以通过诉讼要求确认协议无效，并按照法定标准获得赔偿。

3. 起诉流程与注意事项：

   • 若员工认为协议存在可撤销或无效的情形，并决定提起诉讼，应首先收集相关证据，包括工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论、协议文本、医疗费用凭证、工资流水等，以证明工伤事实、应获赔偿数额以及协议存在的问题。
   • 接着，员工需要准备起诉状，明确原告、被告信息，阐述诉讼请求（如撤销协议并要求按法定标准赔偿），并详细说明事实与理由。
   • 然后，员工应向有管辖权的人民法院提交起诉状及相关证据材料。
   • 最后，员工需要注意诉讼时效，起诉应在法定诉讼时效内进行，一般为从知道或者应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权，以保障自身合法权益。

综上所述，员工与企业签订工伤赔偿协议后诉讼是否合法，需根据具体情况判断。若协议存在不合法、不公平等情形，员工有权通过法律途径维护自身权益。在处理此类问题时，建议员工及时咨询专业律师（即直接向我咨询），以确保自身权益得到充分保障。