员工不在公司上班，居家办公的情况下，是可以签订劳务协议（但更常见的是签订或补充劳动合同相关条款）的，不过具体操作需结合实际情况与法律规定。以下从不同角度为你详细分析：

1. 劳务协议与劳动合同的区分及适用

• 劳务协议：通常用于非全日制用工、临时性用工或特定项目合作等场景，双方关系较为灵活，不涉及社会保险等强制性福利待遇。但居家办公的员工，如果其工作内容、管理方式等符合劳动关系的特征（如接受公司管理、提供长期稳定劳动等），则签订劳务协议可能存在法律风险，因为容易被认定为劳动关系，而劳务协议无法全面保障劳动者的权益。
• 劳动合同：对于居家办公的员工，更常见的是签订或补充劳动合同的相关条款，明确双方在居家办公期间的权利义务。劳动合同能够更全面地保障劳动者的权益，包括工资、社会保险、福利待遇等。

2. 居家办公协议的签订

• 协议内容：如果公司决定让员工居家办公，可以签订一份《居家办公协议》，作为劳动合同的补充。协议中应明确居家办公的期限、工作时间、工作任务、薪酬待遇、考勤方式、保密义务等条款。
• 法律效力：该协议作为劳动合同的补充，具有法律效力。双方应严格遵守协议约定，否则可能承担违约责任。

3. 法律建议

• 明确劳动关系：首先，应明确员工与公司之间是否存在劳动关系。如果存在劳动关系，则应签订或补充劳动合同的相关条款，而不是简单地签订劳务协议。
• 完善协议内容：在签订《居家办公协议》时，应确保协议内容合法、合规，且能够全面保障双方的权益。特别是关于工作时间、薪酬待遇、考勤方式等条款，应明确具体、可操作。
• 遵守法律法规：在居家办公期间，公司应继续遵守劳动法律法规，为员工缴纳社会保险、提供福利待遇等。同时，员工也应遵守公司的规章制度和协议约定，认真履行工作职责。

4. 可能的法律后果

• 如果签订劳务协议但实际为劳动关系：可能被认定为劳动关系，而劳务协议无法全面保障劳动者的权益。此时，公司可能面临补缴社会保险、支付经济补偿等法律责任。
• 如果协议内容违法或违规：可能导致协议无效或部分无效。此时，双方应重新协商或依据法律法规处理相关事宜。

综上所述，员工不在公司上班、居家办公的情况下，更合适的是签订或补充劳动合同的相关条款，并可以签订一份《居家办公协议》作为补充。在签订协议时，应确保协议内容合法、合规，且能够全面保障双方的权益。如有任何法律问题或需要进一步咨询，请直接向我提问。