针对您提出的“挂靠项目实际施工人虚开增值税怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确虚开增值税发票的法律后果。根据《刑法》第二百零五条的规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，将面临严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、拘役以及罚金等。单位犯此罪的，还会对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法处罚。

然而，在处理挂靠项目实际施工人虚开增值税的问题时，我们需要考虑具体的实际情况。根据最高法关于《以“挂靠”公司名义为自己虚开增值税发票行为性质》的复函，如果挂靠方以挂靠形式向受票方实际销售货物，被挂靠方向受票方开具增值税专用发票的，这不属于刑法第二百零五条规定的“虚开增值税专用发票”。这是因为，在这种情况下，虽然存在挂靠关系，但挂靠方进行了实际的经营活动，且主观上并无骗取抵扣税款的故意，客观上也未造成国家增值税款损失。

但是，如果挂靠人向被挂靠单位提供了虚开的增值税发票，并导致被挂靠单位因此遭受了税款及滞纳金损失，那么挂靠人需要承担相应的赔偿责任。这一点在相关的司法案例中得到了体现，如某案例中，挂靠人因提供虚开的增值税发票，被判决赔偿被挂靠单位税款及滞纳金损失。

因此，对于挂靠项目实际施工人虚开增值税的处理，我们需要根据具体情况进行判断。如果挂靠方进行了实际的经营活动，且主观上无骗取抵扣税款的故意，那么其行为可能不构成虚开增值税专用发票罪。但如果挂靠人提供了虚开的增值税发票，并导致被挂靠单位遭受损失，那么挂靠人需要承担相应的赔偿责任。

最后，我建议您在处理此类问题时，务必咨询专业的法律人士，以确保您的权益得到妥善保护。同时，也提醒您在经营活动中要遵守相关法律法规，避免涉及违法行为。