在丈夫因虚开增值税专用发票被抓并面临财产没收的情况下，法院是否会保留房子，主要取决于房子的产权归属、是否涉及犯罪所得以及法院的具体裁决。以下是对此问题的详细分析：

1. 产权归属：

   • 如果房子是丈夫个人所有，且被认定为犯罪所得或用于犯罪活动的资金购置，那么法院在判决时很可能会将其作为非法财产予以没收。
   • 如果房子是夫妻共同所有，或者妻子单独所有，且没有证据表明房子与丈夫的犯罪行为有直接关联，那么法院在没收财产时可能会考虑保留妻子的合法权益，不对房子进行没收。

2. 是否涉及犯罪所得：

   • 如果房子是丈夫通过合法途径购置，且没有使用犯罪所得资金，那么法院在没收财产时通常会尊重房子的合法性，不会将其没收。
   • 如果房子被证实是使用犯罪所得资金购置的，或者与犯罪活动有直接关联，那么法院很可能会将其作为非法财产予以没收。

3. 法院的具体裁决：

   • 法院在判决时会综合考虑案件的具体情况，包括丈夫的犯罪性质、情节、社会危害程度以及妻子的合法权益等因素。
   • 如果法院认为保留房子对妻子和孩子的生活至关重要，且房子与丈夫的犯罪行为没有直接关联，那么可能会作出保留房子的裁决。

综上所述，法院是否会保留房子是一个复杂的问题，需要综合考虑多种因素。如果妻子担心房子被没收，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律程序和权益保护措施。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和帮助。