拆除未经法定程序认定违法建筑的房屋，若后续被推定为合法建筑，赔偿应依据合法建筑的市场价值进行。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律原则：

   • 在未经有权机关依法定程序认定之前，不能径行否定建筑的合法性。
   • 行政执法机关若违法强制拆除房屋，必然给权利人造成财产损害，权利人依法享有获得行政赔偿的权利。

2. 案例分析：

   • 以江某龙案为例，喀什城管局在拆除江某龙涉案房屋前，未对房屋是否为违法建筑作出相关决定，即径行拆除，被法院认定为违法。
   • 法院认为，由于喀什城管局拆除行为违法，依据《中华人民共和国国家赔偿法》的规定，喀什城管局应当承担相应的赔偿责任。
   • 涉案房屋并未被依法认定为违法建筑，因此，出于保障当事人合法权益的目的，法院酌定按合法建筑的市场价值予以赔偿。

3. 赔偿标准：

   • 若房屋被推定为合法建筑，赔偿应不低于该房屋的市场价值。
   • 具体数额需综合考虑房屋的地理位置、房屋用途、房地产价格波动情况等因素。
   • 若屋内物品因拆除而损毁，赔偿数额还应包括屋内物品的损失。

4. 法律建议：

   • 若面临类似情况，建议权利人首先保留好相关证据，如房屋租赁合同、购房凭证、屋内物品清单及购买凭证等。
   • 及时咨询专业律师，了解自身权益及可能的赔偿途径。
   • 若行政执法机关存在违法行为，可通过法律途径维护自身权益，要求赔偿损失。

综上所述，拆除未经法定程序认定违法建筑的房屋，若后续被推定为合法建筑，赔偿应依据合法建筑的市场价值进行，并需综合考虑多种因素以确定具体赔偿数额。若您有相关法律问题，可直接向我咨询。