学徒离职时公司扣掉工资是否合法，需根据具体情况来判断。

首先，我们要明确的是，无论是学徒还是正式员工，其工资都是受法律保护的，不能随意被扣除。接下来，我将从几个角度来分析这个问题：

1. 合同约定：

   • 如果学徒与公司签订了劳动合同或培训协议，并且其中明确规定了离职时工资的处理方式，那么应当按照合同约定执行。
   • 如果合同中没有相关规定，或者规定与法律法规相冲突，那么公司不能随意扣除学徒的工资。

2. 法律法规：

   • 根据《劳动法》和相关规定，员工离职时，公司应当结清其应得的工资。
   • 如果公司存在无故拖欠或克扣员工工资的行为，员工有权向劳动监察部门投诉，甚至提起劳动仲裁或诉讼。

3. 实际情况分析：

   • 如果学徒在离职前已经按照合同约定或公司规定完成了工作任务，且没有违反任何规章制度，那么公司无权扣除其工资。
   • 如果学徒在离职前存在未完成工作、违反规章制度或给公司造成损失等情况，公司可能会根据合同约定或公司规定扣除部分工资作为赔偿或处罚。但这种扣除必须是合理且合法的，不能超出法律法规的范围。

综上所述，学徒离职时公司扣掉工资是否合法，取决于具体情况和合同约定。如果公司无故扣除学徒工资，学徒可以依法维护自己的权益。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议和帮助。